近年来，我国太湖富营养化程度不断加剧，水污染日趋严重，其中梅梁湾地区的污染最为严重，对太湖流域的人民生活和经济发展造成严重不利影响。太湖水华的优势藻种为铜绿微囊藻(Microcystis aeruginosa)，水华暴发时，能形成肉眼可见的颗粒，同其上定殖的微生物共同组成一个复杂的微生态系统，对彼此的生长产生相互影响。同时，水华暴发期间，水体中的细菌群落结构会发生改变。因此，研究附生菌在铜绿微囊藻团表面的定殖过程及水华暴发期间细菌区系分析对于研究水华期间微囊藻同细菌间相互作用机理有着重要意义。　　 本论文从实验室研究和野外动态监测两个方面研究水华暴发过程中铜绿微囊藻同其表面和水体中细菌间的相互作用。首先在实验室条件下以铜绿微囊藻和3株铜绿微囊藻的附生菌作为研究对象，研究附生菌在铜绿微囊藻团表面的定殖过程，附生菌形成生物膜的能力对其定殖过程的影响。研究结果表明，处于不同生长状态的铜绿微囊藻团对其表面的附生菌定殖过程的影响不同。另外还使用变性梯度凝胶电泳技术对梅梁湾和贡湖湾水华暴发期间细菌群落结构变化进行月际动态监测。结果表明，水华暴发期间，作为草型湖泊的贡湖湾水体内细菌多样性保持比较稳定。同时从细菌群落结构变化的角度分析，证实了梅梁湾水域的生态修复工程取得较好的治理效果。　　 处于对数生长期的铜绿微囊藻团对附生菌在其表面的定殖产生抑制作用，藻体死亡的铜绿微囊藻藻团对附生菌在其表面的定殖产生促进作用，同时由于死亡的藻体无法持续的为附生菌提供营养，所以这种促进作用十分有限。　　 附生菌通过形成生物膜附着在铜绿微囊藻团表面，而附生菌生物膜的形成能力对定殖在藻团表面的附生菌的数量有影响。形成生物膜能力强的附生菌能牢固的附着在微囊藻团的表面，从而支持更大数量的附生菌参与定殖。　　 水华暴发期间草型湖泊细菌群落结构的稳定性要高于藻型湖泊，草型湖泊和藻型湖泊细菌群落结构表现出明显的不同。　　 通过实施生态修复工程，梅梁湾水域的生态系统得到不同程度的修复，其中第二层围隔内水域生态系统修复效果较好，与对照样点相比，细菌的群落结构的稳定，且遭到破坏后能迅速恢复。第三层围隔内水域生态系统修复效果比第二层围隔内水域稍差，但和对照组相比，细菌的群落结构仍然保持一定的稳定性，但当其遭到破坏后，不能恢复至初始状态。