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地中海拟无枝菌酸菌(Amycolatopsis mediterranei)U32中有两条途径来同化铵，分别是谷氨酰胺合成酶/谷氨酸合酶(GS/GOGAT)途径和丙氨酸脱氢酶(AlaDH)途径。在氮源丰富的条件下，U32主要采用AlaDH途径，催化丙酮酸和氨生成丙氨酸来同化铵；而在氮源匮乏的条件下，U32则采用GS/GOGAT途径。俞浩博士等曾证明在氮源匮乏的条件下，GInR正调控GS编码基因——glnA的转录；本研究工作则发现GlnR同时还负调控丙氨酸脱氢酶编码基因——ald的转录，所以在U32中GlnR蛋白负责铵同化途径的调控。通过比较glnA和ald启动子中受GlnR保护的DNA序列发现了16-bp的保守序列，定义为GInR Box。GlnR Box在glnA启动子中是连续的，而在ald启动子中则被分开为两个8-bp的Boxl和Box2，间隔76个碱基。在体外通过原子力显微镜(AFM)实验证实了ald启动子可以形成一个DNAloop，在空间上将分开的Boxl和Box2连在一起，从而形成一个完整的GlnR Box，其中，ald基因主要的(也是受调控的)转录起始位点P2位于GInR Box2中。显然，GlnR蛋白通过结合到GlnR Box上从而阻碍了ald从P2位点起始的转录，这也解释了U32体内GlnR负调控ald转录的分子机制。在模式放线菌——天蓝色链霉菌(Streptomycescoelicolor)中也发现了类似的GlnR Box存在。在氮源贫瘠时，GlnR Regulon(Tiffert et al.，2008)中只有启动子中含有GlnR Box的基因才受到GlnR蛋白的调控，其余的基因则不受调控。利用GlnR Box在S.coelicolor基因组中找到了新的GlnR靶标基因——nasA，并证明了GlnR通过结合nasA启动子中的GlnRBox，从而正调控nasA的转录。因此，无论在A.mediterranei还是在S.coelicolor中，GInR都是通过结合GlnR Box来调控靶标基因的表达，从而负责整个铵同化(或氮代谢)的调控。