云南作为边疆民族地区,其独特的地理、气候特点,复杂的自然环境状况,突出的民族情况,致使鼠疫能够依托自然疫源地长期在该地区存在,并在一定条件诱发下形成人间流行。鼠疫的肆虐对云南社会的发展产生了巨大影响,而云南社会的发展也影响了鼠疫的发生和流行。本文从环境史角度研究清代云南鼠疫。通过对历史文献中出现的“大疫”、“瘟疫”、“时疫”等词的等级辨别,论述历史文献资料中“疫”情与鼠疫疫情间的对等关系,探讨辨别鼠疫的外在环境条件；梳理从康熙二十二年至光绪末年,清代云南鼠疫发生、流行的特点和分布情况。在此基础上提出清代云南鼠疫流行深受自然环境的影响,呈现出固有疫源地鼠疫流行,引发毗邻地区鼠疫流行的流行特点。论述清代云南社会的高度发展,使得人类在改造自然的同时,也改变了依托自然环境条件存在的鼠疫流行区域。而鼠疫流行区域的改变,又影响了云南自然环境和社会环境的变迁。由此认为清代云南鼠疫的流行,自然疫源地存在是基础,清代云南社会发展是推动力。总结指出清代云南鼠疫流行与环境间的关系：认为云南地区的自然环境,影响了鼠疫这类环境性疾病的发生和流行；而环境性疾病的流行,对于人类的环境意识和卫生经验的提升也起到了推动作用。结合云南的民族环境特点,认为云南少数民族的某些风俗,是疾病发生和流行的有力人为社会因素。最后揭示出清代鼠疫在云南地区流行的过程中,逐渐从单一疾病转变为环境灾害现象。