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目的:检测原发性肝癌与肝转移瘤患者血液中循环肿瘤DNA,观察原发性肝癌组织中的突变基因与原发性肝癌患者循环肿瘤DNA中基因突变是否一致;比较其中突变基因位点,评估不同突变基因在原发性肝癌的临床诊断中的价值。方法:提取血浆ctDNA,利用Agilent的液相芯片捕获技术捕获癌症发生发展密切相关的基因,通过Illumina HiSep测序平台进行高通量测序,检测肝癌的多个基因变异类型,得到不同变异位点注释结果。在cosmic数据库中查找出原发性肝癌组织中检测到的20个高频突变基因。分别记录这20个高频突变基因在两组样本中突变位点情况,筛选后基因位点情况,结果进行对比、分析。结果:(1)原发性肝癌和肝转移瘤患者血浆中循环肿瘤DNA提取测序均可检测出不同的癌症相关基因位点,其中对比原发性肝癌组织的高频突变基因,原发性肝癌中可检测到绝大部分原发性肝癌组织中的突变基因位点,具有一致性。(2)20个原发性肝癌组织高频突变基因在原发性肝癌患者循环肿瘤DNA中17个基因检测到突变位点,其中LRP1B、KMT2C、ALK、PTPRT、SETD2、ATM、PTEN等7个基因在所有样本中均有发现突变位点。(3)原发性肝癌ctDNA经过筛查后,高频突变基因中发现基因位点的有9个:LRP1B、TSC2、PTEN、PTPRT、ATM、ARID1A、KMT2C、ALK、ZNF521,因此可以得出既在原发性肝癌中突变频率高又于疾病发生相关性较大的基因为LRP1B、KMT2C、ALK、PTPRT、ATM、PTEN等6个基因。(4)20个原发性肝癌组织高频突变基因在肝转移瘤患者循环肿瘤DNA中13个基因被检测到突变位点,通过筛查符合条件的基因有KMT2C、ATM,以这两个基因作为反面对照。LRP1B、KMT2C、ALK、PTPRT、ATM、PTEN等6个基因经过反面对照后,最终得出对LRP1B、PTEN、PTPRT、ALK这4个在原发性肝癌组中基因发生突变频率高,与疾病发生相关性较大的基因。结论:(1)原发性肝癌患者血液中循环肿瘤DNA可检测到绝大部分原发性肝癌组织高频突变基因的突变位点,验证了循环肿瘤DNA携带有原发性肝癌肿瘤组织的特异性遗传学信息。(2)LRP1B、PTEN、PTPRT、ALK在原发性肝癌中突变频率高,考虑其与肝癌发生发展过程相关性较大,可作为肝癌诊断参考基因,其中LRP1B尚未有报道,具有进一步研究价值。