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本试验以12个辣椒品种或材料为试材，研究了辣椒生理生化特性、农艺性状和抗病性间相关性；应用POD同工酶对12个辣椒材料，进行亲缘关系的鉴定；高效液相色谱法测定辣椒素。得出以下试验结果：(1)简单相关分析表明：单果重和果长、果宽、果柄长度、肉厚呈正相关，与结果数呈负相关。株高与株幅呈极显著正相关。果长与果柄长度呈极显著正相关，与单果重呈显著正相关。果宽与肉厚呈显著正相关，与单果重呈极显著正相关，与结果数、辣椒素含量呈显著负相关。肉厚与单果重、PPO同工酶活性呈显著正相关，与结果数呈负相关。干物质与辣椒素呈显著正相关。POD活性、PPO活性与疫病病情指数呈显著正相关。(2)产量因素组与果实性状组，抗病性与叶片生理生化指标，抗病性与果实营养含量典型相关关系数都达到极显著水平。其它俩俩之间典型相关分析均未达到显著水平。一般与多个性状组间的典型相关分析达到显著水平，但最大的典型相关系数包含的遗传信息占总相关信息的比率反而减小。(3)典型相关分析表明：单果重与果长、果宽、肉厚间呈显著正相关，抗病性和POD活性、PPO活性、干物质含量间呈显著正相关，而抗病性与PAL活性呈负相关，但相关性不显著。(4)不同浓度分离胶分离效果：POD、PPO同工酶皆以10％的分离胶分离效果最好，得到的酶带最清晰，有利于进行相关分析。12个辣椒品种或材料遗传距离在0～0.51范围内，当遗传距离为0.36时，可以将其分为三类。当遗传距离为1.9时，可以将其分为六类。(5)高效液相色谱法测定辣椒素的色谱条件：流动相为V甲醇：V水=75：25，流速为1.2ml／min，UV检测器检测波长为280nm，柱温25℃。12份辣椒样品辣椒素含量在0.07～8.02(mg／g)之间，辣椒素含量最高的为来源于四川雅安的野山椒-1，其口感为极辣，其次为野山椒-2、朝天椒-2、朝天椒-1，辣椒素含量最低的为来源于山东胶州的胶州长海椒。