家蚕肠粘蛋白基因的鉴定及功能分析

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昆虫中肠围食膜(Peritrophic membrane,PM)作为昆虫食下感染的第一道防御屏障,能保护中肠上皮免受机械损伤、化学物质伤害以及病原体的感染,并具有消化道区室化,循环利用消化水解酶,并充分吸收营养物质的功能。昆虫肠粘蛋白(Insect Intestinal Mucin,IIM)是PM的重要组成成分,具有维持PM结构致密、润滑肠道,保护中肠上皮细胞免受病原微生物的侵染、物理和化学伤害等功能。同时,ⅡMs也作为杀虫剂靶标受到广泛关注。ⅡMs功能上的重要性与ⅡMs研究的有限形成强烈反差。由于昆虫ⅡMs的结构复杂,研究难度大,迄今为止对昆虫ⅡMs的研究还十分有限。目前已知的昆虫ⅡMs的分离鉴定主要是通过构建cDNA文库和抗体筛选得到。全基因组数据为研究ⅡMs基因提供了全新的视角。本研究基于全基因组数据鉴定了家蚕ⅡMs基因,并研究了家蚕ⅡMs基因的可变剪接及其在BmNPV感染后ⅡMs基因不同剪接形式的表达情况,RNA干涉为理解家蚕ⅡMs基因的功能提供了实验证据。本研究不仅增加了昆虫ⅡMs基因的知识,也为家蚕的中肠PM保护提供了新的思路。取得研究结果如下:1.家蚕ⅡMs基因的鉴定本研究利用生物信息学方法,在家蚕全基因组中预测出4个ⅡMs基因。预测的4个家蚕ⅡMs基因主要在中肠表达,进一步证实这4个基因为家蚕ⅡMs基因。2.家蚕ⅡMs基因的可变剪接分析本研究利用基因组数据和转录组数据,预测并实验验证了家蚕BmIIM2基因存在5种剪接形式,BmIIM4基因存在4种剪接形式,BmIIM1和BmIIM3两个基因没有发现可变剪接。比较家蚕幼虫食下BmNPV后ⅡMs基因不同剪接形式的表达情况,发现BmIIM2-5的表达不受BmNPV侵染影响,其余8种剪接形式的表达受BmNPV侵染影响。BmllM2和BmIIM4两个基因的剪接形式均可划分为两类。BmIIM2基因有BmNPV侵染诱导表达的剪接形式和不受诱导表达的剪接形式。BmIIM4基因有BmNPV感染早期上调表达、晚期下调表达的常规表达的剪接形式和感染早期下调表达、晚期上调表达的非常规表达的剪接形式。显示家蚕ⅡMs基因及其不同剪接形式在与BmNPV互作中的功能有很大不同。3.干涉ⅡMs基因对家蚕幼虫存活率的影响家蚕经口感染BmNPV后,BmIIM2、BmIIM3和BmIIM4三个基因上调或下调表达。利用RNA干涉方法,发现干涉BmIIM1、BmIIM3和BmIIM4三个基因后家蚕幼虫受BmNPV侵染后的存活率与对照组相比无显著差异,而干涉BmIIM2基因后家蚕幼虫受BmNPV侵染后的存活率显著降低,显示BmIIM2基因可能参与了家蚕对BmNPV的抵抗。综上所述,我们发现家蚕ⅡMs基因虽数目较少,仅有4个,但存在可变剪接。家蚕不同ⅡMs基因在与BmNPV互作中所起的作用不同,且家蚕ⅡMs基因不同剪接形式在与BmNPV互作中扮演的角色也有差异。RNA干涉初步显示只有BmIIM2基因在抵抗BmNPV的入侵中有作用。
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