我国对水资源实行流域管理与行政区域管理相结合的水资源管理体制。为此，本文以区域水资源管理中流域机构和区域水行政主管部门这两个主要的管理主体为研究对象，建立区域水资源管理评价模型、利益导向下的管理行为均衡模型，对基于流域水资源统一管理的区域水资源管理进行深入研究。 1) 在前人研究的基础上，系统分析了流域水资源统一管理的内涵，并对流域与行政区域、流域管理与区域管理以及流域管理与行政区域管理相结合的管理体制进行了系统的论述。 2) 建立以流域与区域结合度为目标层的指标体系，并应用多层次模糊评价法，构建区域水资源管理评价模型。 3) 从水资源的自然特性出发，分析区域水资源管理过程中的利益结构、利益格局及其影响因素，据此提出利益导向下的区域水资源管理模式。 4) 系统分析区域水资源管理中利益、制度对管理行为的影响，据此建立管理行为的均衡模型，并分别从区域间的博弈和流域与区域间的博弈两个维度来探索实现行为均衡的途径，阐明区域水资源管理冲突与合作的互动关系。 5) 有针对性的设计以提高流域与区域结合度为目标的区域水资源管理改革与创新方案。 6) 根据上述评价模型、利益格局、博弈模型，对淮河流域安徽段的水资源管理进行实例研究。