猪心肌线粒体呼吸链复合物Ⅱ，又称琥珀酸：泛醌氧化还原酶(succinate：ubiquinone oxidoreductase，SQR)，是一个完整的跨膜蛋白复合物，在线粒体呼吸链中起重要作用，它不仅参与了三羧酸循环并且是有氧呼吸过程不可缺少的组成部分。本研究对SQR进行分离提纯以及性状分析，进而获得分辨率为2.4(A)的蛋白晶体。在此基础上得到它与抑制剂3-nitropropionate(NPA)和2-thenoyltrifluoroacetone(TTFA)形成的蛋白-抑制剂复合物晶体结构，分辨率为3.5(A)，在此基础上从原子水平对线粒体呼吸链系统和泛醌分子还原机制进行了阐述。猪心肌线粒体复合物Ⅱ含有2个亲水亚基，即黄素蛋白(Fp)和铁硫蛋白(Ip)，以及2个疏水跨膜亚基(CybL和Cybs)，还含有5个电子传递所必需的辅基。猪心肌线粒体复合物Ⅱ有2个泛醌结合位点：Qp和Qd，在蛋白抑制剂复合物晶体结构中，它们与泛醌类似物TTFA结合，为研究泛醌结合位点提供了依据。此外，通过对猪心肌线粒体复合物Ⅱ结构的研究发现，很多重要的氨基酸残基与线粒体疾病相关，它们的突变直接导致线粒体疾病的发生。