拟南芥碱敏感突变体scs46-1的克隆和转录组分析

来源 :浙江农林大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:caochangzheng
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盐碱土由盐土和碱土构成,在我国的分布广泛,是重要的后备耕地资源。植物对盐胁迫的响应机制已经在模式植物拟南芥中有了较深入的研究,然而,碱胁迫对植物的影响的研究较少,而且主要是非模式植物,对其具体机制并不清楚。本课题选用拟南芥为研究对象,选用碱土主要成分Na HCO3进行胁迫处理,通过正向遗传筛选突变体的方法,寻找调节植物耐碱的基因。实验中,我们利用化学诱变剂EMS诱变了约一万粒种子,并用3 m M的Na HCO3对M2代种子进行了筛选,获得了一系列敏感表型(叶片发黄、根卷曲)的候选突变体,命名为sodium bicarbonate sensitive(scs)。通过二代测序的方法,我们对表型稳定的突变体scs46-1进行了突变体位点定位,并锁定了四个候选基因。通过检测四个候选基因的T-DNA突变体的Na HCO3表型,发现At2g XX300的突变体对Na HCO3敏感,而过表达At2g XX300能增强植株对的耐受。初步确定SCS46-1是At2g XX300。为了研究SCS46-1调节植物Na HCO3耐受的信号途径,我们对野生型和scs46-1进行了转录组测序。通过GO和KEGG富集分析,发现scs46-1中氮、亚麻酸、抗坏血酸与醛酸盐代谢、精氨酸和脯氨酸代谢通路相关基因显著富集。推测SCS46-1可能通过以上通路影响植物对Na HCO3的耐受能力。
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