本文以中国北方沿海的扁玉螺(Neverita didyma Roding)野生群体为研究对象，应用简单重复序列区间扩增(inter simple sequence repeat，ISSR)分子标记技术，对扁玉螺的遗传多样性进行了研究，从群体遗传学角度揭示了扁玉螺野生群体的遗传结构，对其种质资源的遗传多样性进行了评估，探讨了不同野生群体之间的遗传关系，以期为保护和合理利用扁玉螺种质资源提供理论依据。主要研究结果如下： 1、通过优化ISSR-PCR反应体系，从30个ISSR引物中筛选出13个用于ISSR分析。13个引物均显示出不同程度的多态性，在3个群体90只个体中共检测到161个位点，平均每个引物记录12.4个位点，扩增产物的分子量大多在200 bp-1600 bp之间。 2、多态性位点比例和Shannons指数是衡量群体遗传多样性的重要指标之一。实验结果显示：青岛、大连和烟台3个群体的多态性位点分别为74.53％、74.53％、85.09％，可见，烟台群体的多态性位点比例明显高于青岛和大连群体，虽然大连群体和青岛群体的多态位点百分率相同，但综合Shannons信息指数(I)和Neis基因多样性指数(h)两组数据来看，各群体遗传多样性水平的高低依次为YT>QD>DL。 3、Neis基因多样性指数(h)和Shannons信息指数(I)在群体水平上分别为0.2811和0.4189，在物种水平上分别为0.3395和0.5113，显示出扁玉螺群体拥有较高的遗传多样性水平，物种水平的遗传多样性高于群体水平。群体内遗传多态度比例(Hpop/Hsp)为0.7873，群体间遗传多态度比例(Hsp-Hpop)/Hsp为0.2127，即扁玉螺群体发生的遗传变异有78.73％存在于群体内，21.27％的变异存在于群体间，这说明群体内的变异是导致群体间分化的重要因素。 4、利用AMOVA的等级剖分法得出的群体间和群体内对总的遗传变异的贡献率表明，扁玉螺27.16％的变异发生在群体间，72.84％的变异发生在群体内，显著性检验显示扁玉螺群体间和群体内均有极显著的遗传分化(φst=0.2720，P<0.001)。这与上述3中的分析结果是一致的。 5、群体内的遗传相似度反映了群体内个体间的遗传差异，本实验结果显示：QD群体内个体间的遗传相似系数平均为0.7709；YT群体内个体间的遗传相似系数为0.7307；DL群体内个体间的遗传相似系数为0.7824，表明YT群体内个体间的遗传差异较大。 6、遗传距离(D)和遗传相似度(S)是衡量群体间遗传变异程度的重要参数，S值越大，表明亲缘关系越近，遗传变异越小；而D值越大，则表明亲缘关系越远，遗传变异越大。通过对青岛、大连和烟台3个群体之间的遗传相似系数和遗传距离进行比较的结果显示：QD与DL之间的遗传距离最大，DL与YT群体间的遗传距离最小。遗传相似度的结果为YT与DL群体间的遗传相似系数最大。表明在扁玉螺3个自然群体中，DL与YT之间的亲缘关系较近，DL与QD之间的亲缘关系较远。 7、根据群体间的遗传距离和个体间的遗传相似度，用NTSYS V2.20软件中的不加权类平均聚类法(UPGMA)分别对三个群体及三个群体的90只个体进行聚类。结果显示：群体间的聚类结果与上述6完全相同；QD、DL和YT群体内的各30只个体分别汇聚成各自独立的一支，表明群体内的个体间有高度的遗传相似性。 8、扁玉螺3群体之间的基因分化系数(Gst)为0.1720，由Gst估算的基因流(Nm)为2.4063。这表明3群体之间存在着有效的基因流，遗传漂变不是影响扁玉螺群体遗传分化的主要因素；引起扁玉螺群体遗传分化的因素可能与其繁育方式、各居群之间分布不连续造成的地理隔离、以及人为过度采捕导致资源量减少等因素有关。