血小板减少症患儿肠道菌群分析及意义

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研究目的本研究运用16S r DNA可变区高通量测序的方法,对新发的血小板减少症患儿肠道菌群及健康儿童肠道菌群构成进行对比分析,旨在寻找血小板减少症患儿肠道菌群与健康儿童存在的差异,并通过肠道菌群的改变情况,分析血小板减少症发病的影响因素。以此来探究肠道菌群对血小板减少症患儿的影响,为血小板减少症患儿的诊疗提供新思路。研究方法本研究纳入2021年5月至2021年11月于大连市妇女儿童医疗中心院内诊断为血小板减少症的患儿15例作为实验组(A组),选取大连地区15名健康儿童作为对照组(B组),采集研究对象粪便样本,运用CTAB法(Cetyltrimethylammonium Bromide,十六烷基三甲基溴化铵法)提取样本DNA,对提取的DNA样本进行质量检测,对于检测合格的样本,进行进一步的PCR扩增、纯化、以及建库。通过应用Agilent 2100 Bioanalyzer软件,可以对建立的文库进行质量检验。当文库检验合格后,可以运用合适的平台,对于所建立的文库进行测序。对测序所得的数据进行过滤,去除低质量的数据,对剩余的高质量数据进行拼接,将具有97%相似度的测序片段进行归类,相似的片段聚类成为1个OTU(Operational Taxonomic Units,分类操作单元),通过对分类操作单元在Greengene数据库比对,对分类操作单元进行物种注释。得到物种注释结果后,可以依据OTU及其物种注释结果,对肠道菌群进行详细的分析。研究结果对肠道菌群的多样性进行分析,运用Alpha多样性评估组间物种数量和均匀度差异,结合Beta多样性进一步评估组间生物群落之间的分化程度的差异,结果显示血小板减少症组儿童肠道菌群的丰富度及多样性均较健康对照组降低。对肠道菌群的物种组成进行分析,在各级别生物学分类水平中,血小板减少症组患儿肠道菌群与健康组儿童存在差异:与健康组相比,血小板减少症组儿童肠道菌群中厚壁菌门及柔膜菌门丰富度降低,蓝藻门丰富度升高。梭菌纲及柔膜菌纲丰富度下降;梭菌目、RF39、巴斯德氏菌目丰富度下降;瘤胃球菌科丰富度下降;栖粪杆菌属、罗氏菌属、瘤胃球菌属丰富度下降;柔嫩梭菌、殊异韦荣球菌、粪源罗氏菌丰富度下降,上述结果均具有统计学意义。与健康组相比,血小板减少症组儿童拟杆菌门丰富度上升,差异不具有统计学意义。运用KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,京都基因和基因组百科全书)数据库的差异表达基因功能注释功能对肠道菌群组成进行功能预测,结果显示:血小板减少症组能量代谢相关功能高于健康组,遗传信息处理、环境信息处理以及细胞过程相关功能低于健康组。研究结论1.肠道菌群丰富度及多样性的降低、厚壁菌门丰富度的降低以及拟杆菌门丰富度的升高可能是血小板减少症的发病的潜在因素。2.血小板减少症患儿肠道菌群构成改变导致其能量代谢相关功能高于健康儿童,遗传信息处理、环境信息处理以及细胞过程相关功能低于健康儿童。3.血小板减少症患儿肠道菌群构成发生变化,在临床治疗中,可以考虑对肠道菌群及其代谢产物进行干预,达到辅助治疗的目的。
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