我国牙鲆人工养殖从20世纪90年代开始，目前已发展成为北方沿海的重要经济养殖鱼类。但在苗种生产过程中缺乏适当的育种规划，近交衰退的情况比较严重，因此，急需开展牙鲆良种选育工作。本项研究利用分子标记辅助育种技术和雌核发育技术构建了5个母系半同胞组，12个全同胞家系(包括雌核发育家系和普通人工受精家系)。亲本来自野生鱼和人工繁殖培育选留的亲鱼。跟踪测定2032条牙鲆150、240日龄的体重、体长等多个性状。本文比较了不同选育家系的生长、形态差异；对该阶段牙鲆生长性状估计遗传力和预测育种值；分析了形态特征对体重影响效果。主要结果如下： 1.通过方差分析、聚类分析、离差分析比较了各半同胞组、各家系之间的生长性能的差异，并对所有个体两次测量的体重等指标进行了相关分析，结果表明：5个半同胞组间、组内均存在极显著差异；240日龄体重Duncan多重比较显示，H9922优于其它半同胞组，H0809次之；G1、C2、G3、C42、C52分别为各半同胞组中生长较优的家系，C2、C41、C42三个家系生长优于相应的雌核发育家系；12个选育家系中，C42、C52、C41、G1具有较高的生长优势。两次测量体重相关、体长相关分别为：0.776和0.846，相关较高，表明生长性能正趋向稳定。不同选育家系生长差别为进一步选育提供了理论依据，对牙鲆进行提纯、复壮是十分必要的。 2.通过全同胞组内相关法估计遗传力过程中，依据父系半同胞、母系半同胞及全同胞方差组分获得的三个遗传力差别较大，表明利用该组数据通过全同胞组内相关法不能准确估计出遗传力；应用非求导约束最大似然法(DFREML)和动物模型最佳线性无偏预测(BLUP)，估计体重、体长的方差和遗传参数，并计算了固定效应最优线性无偏估计值(BLUE)和动物个体加性效应值(估计育种值)。结果表明：繁殖方法、出生日期、池对生长性状均有显著影响，估计牙鲆150d和240d体重遗传力分别为0.51、0.78，估计牙鲆150d和240d体长遗传力分别为0.59、0.63，说明选择育种对于牙鲆生长的改良具有巨大潜力。分析结果偏高，可能与环境、试验设计及母本效应有关。通过BLUP法预测育种值来指导选择留种能够提高选择效率，本试验中，对150d体重性状来说，G1估计的平均育种值最高，其次为C42、C52，对240d体重性状来说，G3估计的平均育种值最高，其次为C42、G1。两次测量体重估计育种值的秩相关为0.146，相关较低，可能与两个生长阶段的环境、估计方法及生长性能有关。 3.对12个选育家系9个形态比例参数进行了多元分析，结果表明：选育家系在形态上已经产生一定程度的差异，除了G3、C31、C32外，有亲缘关系的家系均能够较快聚合在一起，表明形态差异主要受遗传背景的影响，即与种质有关；对上述判别形态差异较小的G4、C41、C42三个家系和形态判别差异较大的4个雌核发育家系进一步进行判别分析和主成分分析，判别结果为：G4、C41、C42三个家系综合判别准确率为69.09％，4个雌核发育家系综合判别准确率为85.41％，主成分分析结果为：G4、C41、C42三个家系间差异不明显，4个雌核发育家系间差异较大。 4.对牙鲆的测量性状进行相关分析和通径分析，结果表明，牙鲆7个形态性状均与体重的相关系数达到极显著水平，通径分析过程中踢出了与体长有共线性的全长，揭示了多元分析中多个自变量与依变量的真实关系，体长、体高、尾柄高对体重的通径系数显著高于其它性状，它们是直接影响体重的重要指标。决定系数分析结果与通径分析结果有一致的变化趋势；5月龄和8月龄所选形态性状与体重的复相关指数分别为0.905、0.912，说明影响体重的主要自变量指标己经找到；多元回归分析建立了体长、体高、尾柄高对休重的回归方程，为牙鲆选育提供理论依据。