目前，我国正处于申请加入GPA协议的谈判过程中，一旦加入GPA，国内的自主创新政府采购市场将会面临国外供应商的激烈竞争。在此背景下，采取有效的政府采购措施对于保护我国自主创新产业的发展具有重要意义。本文以绿色出行为视角，研究北京市政府采购公共交通工具对于公共交通自主创新的动态作用，为此，本文以北京市运营的地铁车辆的数量作为北京市政府采购地铁车辆的指标，以地铁车辆发明专利和实用新型专利数量之和作为地铁自主创新水平指标，建立VAR模型，分析北京市政府采购地铁车辆对于地铁自主创新技术水平的动态作用；以福田汽车大中型客车主营业务收入作为北京市政府采购福田新能源公交车的政府采购指标，以福田新能源汽车技术发明专利数量和实用新型专利数量之和作为福田汽车新能源汽车技术自主创新水平指标建立VAR模型，分析北京市政府采购福田新能源公交车对于福田新能源技术自主创新的动态作用。另外，本文以北京市市民公共交通通勤费用占年人均可支配收入之比作为北京市政府采购公共交通服务的指标，以北京市公共交通客运量作为人们绿色出行的指标建立VAR模型，分析北京市政府采购公共交通服务对于人们绿色出行的动态作用。实证分析研究结果表明：北京市公共交通自主创新水平对于北京市政府采购公共交通工具的单位信息冲击的正向响应较大，且在短期较为明显，政府采购对自主创新的方差分解贡献也较大。另外，北京市民的绿色出行指标对政府采购公共交通服务指标的脉冲冲击的正向响应在短期较为明显，且政府采购对于人们绿色出行的方差分解贡献较大。为此，可以得出结论：北京市政府采购公共交通工具促进了公共交通自主创新；北京市政府采购公共交通服务，促进了人们绿色出行。最后，笔者也针对政府采购公共交通及完善公共交通体系建设提出了建议。另外，本文还对北京和上海的私家车车牌制度进行了对比分析，并得出结论：如果北京改为车牌拍卖制度，将车牌拍卖所得收入投入公共交通，将有助于完善公共交通体系，同时缓解政府财政负担。为此，笔者也建议北京市采取私家车车牌拍卖制度。