目的通过对安徽省某三级甲等中医医院2009-2012年基本药物的临床应用情况进行调查与分析，对照基本药物制度对于大型公立医院的具体要求，了解国家基本药物制度实施以来，医院落实国家基本药物制度的程度和基本药物使用种类、金额的趋势，探索中医医院的基本药物使用特点，为推进在公立大型医院尤其是大型中医医院实施基本药物制度提供参考和决策依据。方法以安徽省某三级甲等中医医院2009-2012年基本药物临床应用情况作为研究对象，利用医院HIS系统以及ORACLE数据库系统的检索分析功能，建立数据报表对照国家和安徽省的基本药物目录，运用Excel的数据统计功能，结合图表对比分析医院基本药物使用种类、使用金额的变化趋势，运用SPSS19.0统计软件的秩和检验方法比较不同医疗保险类别患者以及不同临床科室之间基本药物使用的差异，了解医院基本药物使用的总体状况。结果基本药物制度实施以来,2009-2012该院的基本药物无论是种类上还是数量上都保持稳定，西药基本药物种类连续保持在90%以上，西药基本药物使用金额比例保持在10%以上，中成药使用比例保持在5%以上，符合政策要求，且药品收入增长速度与医院服务量增长速度保持一致；根据秩和检验，不同类别患者之间基本药物使用没有差异性，不同临床科室之间基本药物使用具有统计学差异；门诊及住院中草药使用比例逐年增长。结论（1）该院基本药物的使用种类以及使用金额达到制度要求；（2）临床基本药物使用并未因患者类别不同而区别；（3）各临床科室由于治疗疾病类别不同在基本药物的选择使用上有区别；（4）该院一系列促进中药使用的措施行之有效，中草药及院内中药制剂使用比例逐年增长，体现该院中医内涵建设不断深化，以及群众对中医中药的需求日益增长。