国家竞争力越来越体现在以自主创新能力为核心的科技实力上。国务院发布的《国家中长期科学和技术发展规划纲要(2006-2020年)》提出必须把提高自主创新能力作为国家战略。企业是自主创新活动的主体,但我国目前企业自主创新能力不强、动力不足。创新活动的高风险性和创新产品的正外部性决定了企业自主创新对财政优惠政策的需求性和财政对企业自主创新供给优惠政策的必要性,所以各国普遍采用财政优惠政策激励企业自主创新。但我国现行的企业自主创新财政优惠政策的激励效应不高,没有根据企业自主创新的特点和各项财政优惠政策的特点形成科学合理的激励机制。在这样的历史背景下,全面、深入地对企业自主创新财政政策激励机制进行研究,对于正确制定我国企业自主创新财政优惠政策、完善企业自主创新财政政策激励机制,具有重要的意义。本文在综合国内外学者研究成果的基础上,首先对企业自主创新财政政策激励作用的机理、效应和机制进行了理论分析,然后运用SD方法对理论分析中构建的企业自主创新财政政策激励作用系统进行了实证分析,最后结合理论和实证分析结果提出了完善我国企业自主创新财政政策激励机制的政策建议和措施。本文的主要创新和结论有以下几个方面:第一,理论分析方面,构建了企业自主创新财政政策激励机理模式图和激励效应评价体系图,在此基础上对企业自主创新财政政策激励机制构建了系统,并对其进行了基于系统观的分析。第二,实证分析方面,建立了企业自主创新财政政策激励作用系统的SD概念模型和SD量化模型,并用Vensim软件对系统进行了SD模拟分析,模拟分析结论主要有两个方面:①评价了各项财政优惠政策对企业自主创新的激励效应;②得出了提高企业自主创新财政政策激励效应的各种财政优惠政策组合方案。第三,政策建议方面,得出了提高我国企业自主创新财政政策激励效应的财政优惠政策体系的优化方案,并在此基础上提出了完善我国企业自主创新财政政策激励机制的政策建议与措施,主要包括:①加大财政科技拨款和政府R&D投入力度,把财政科技拨款占财政支出的比例提高到4.9%,把政府R&D投入流向企业的部分占财政支出的比例提高到1%;②提高研发阶段的贷款贴息率和研发成果商品化阶段的贷款担保力度,把贴息率提高到71%,把财政担保金占财政支出的比例提高到0.8%;③提高研发费用的税前列支比例和固定资产的加速折旧率,分别提高到170%和0.1;④增大政府对自主创新产品的采购规模,把政府采购金占财政支出的比例提高到11%;⑤取消免税期,保持优惠的企业所得税税率为0.15不变;⑥加大营业税和增值税的优惠力度,把优惠的营业税税率和优惠的增值税税率分别降低到0.025和0.06,并将生产型增值税转变为消费型增值税。