第一部分浙江省非结核分枝杆菌流行病学和生物芯片的临床应用价值研究
　　目的：基于生物芯片技术，通过多中心研究，分析浙江省非结核分枝杆菌的流行情况及芯片技术临床应用价值评价。
　　方法：收集浙江省内7个城市总共1751份不重复的快速抗酸染色涂阳痰标本，用生物芯片的方法直接对痰标本进行菌种鉴定，将其结果与金标准(hsp65,16SrRNA和rpoB等方法)进行对比。
　　结果：在所有1751个痰标本中，成功培养了1685份标本。在这些样本中，结核分枝杆菌(TB)有1361份，非结核分枝杆菌(NTM)为323份，奴卡菌1份。323份NTM中，大多数是胞内分枝杆菌(52.5％)，其次是脓肿分枝杆菌(20.7％)、鸟分枝杆菌(11.7％)、堪萨斯分枝杆菌(9.6％)和偶发分枝杆菌(1.9％)。生物芯片检测法从快速抗酸染色涂阳痰标本中区分TB和NTM的敏感性、特异性、阳性预测值和阴性预测值分别为99.8％、99.7％、99.9％、99.1％和98.8％、1、1、99.7％。浙江省内非结核分枝杆菌的阳性分离率为19.2%。生物芯片检测法和分枝杆菌培养物测序法用于NTM菌种鉴定的一致性为95.4％。
　　结论：浙江省内非结核分枝杆菌的分离率较高。最常见的5种非结核分枝杆菌是胞内分枝杆菌、脓肿分枝杆菌、鸟分枝杆菌、堪萨斯分枝杆菌和偶发分枝杆菌。生物芯片检测法是对抗酸染色涂阳痰标本进行快速菌种鉴定的可靠工具。
　　第二部分快生长分枝杆菌的表型和基因型研究
　　目的：对所有的快生长分枝杆菌(RGM)进行表型和基因型分析，了解浙江省内RGM的药敏情况、可能耐药机制，帮助指导临床用药。通过遗传学分析，探究脓肿分枝杆菌能否在人群之间相互传播。
　　方法：对第一部分鉴定为RGM的菌株进行体外药敏试验和全基因测序，运用统计学方法和生物信息学方法进行分析。
　　结果：经全基因测序(WGS)得到53株脓肿分枝杆菌，8株偶发分枝杆菌，2株休斯顿分枝杆菌和1株龟分枝杆菌。RGM对阿米卡星、头孢西丁、利奈唑胺药物耐药率低，对卷曲霉素、多西环素和碳青霉烯类耐药率高。乙胺丁醇、利福平、异烟肼和链霉素的MIC值较高。所有快生长分枝杆菌都能被贝达喹啉和替加环素以非常低的MIC抑制住。53株M.abscessus形成株脓肿亚型和马赛亚型两个聚类。克拉霉素对马赛亚型的抗菌效果明显优于脓肿亚型(p＜0.001)，克拉霉素耐药与erm(41)基因有明显关联。
　　结论：浙江省M.abscessus以脓肿亚型为主(38，71.7%)，其次是马赛亚型(15，28.3%)。通过对脓肿分枝杆菌进行遗传学分析，发现存在脓肿分枝杆菌在无肺囊性纤维变性(CF)的患者中相互传播的可能。RGM对利福平、异烟肼、乙胺丁醇、链霉素等普遍耐药。阿米卡星、利奈唑胺、替加环素等药对RGM具有很好的抗菌效果。克拉霉素对马赛亚型的效果要明显优于脓肿亚型，主要是因为脓肿亚型普遍携带erm(41)T28基因，该基因可导致细菌对克拉霉素产生诱导耐药，而马赛亚型很少携带erm(41)基因。贝达喹啉对所有RGM都有很好的效果，MIC值很低且范围很稳定，该药物有望成为RGM治疗的重要组成之一。
　　第三部分结核和非结核分枝杆菌肺病的临床诊治现状对比
　　目的：通过对比肺结核和非结核分枝杆菌肺病的临床特征和随访结局，了解目前非结核分枝杆菌肺病的临床诊治现状。
　　方法：收集2016年6月-2017年12月期间所有鉴定结果为分枝杆菌属的菌株信息，最终筛选出肺结核106例，非结核分枝杆菌肺病72例。收集这些患者的临床信息，并逐一进行电话随访，对两组患者的基本信息、临床表现、痰涂片结果、培养结果、T-SPOT结果、治疗方案、治疗时间、耐药情况、治疗结局、并发症、是否中断治疗及中断原因等进行分析和对比。
　　结果：我院非结核分枝杆菌以胞内分枝杆菌为主(35株，48.6%)，其次是鸟分枝杆菌11株(15.3%)和堪萨斯分枝杆菌10株(13.9%)，最常见的快生长分枝杆菌是龟/脓肿分枝杆菌11株(15.3%)。非结核分枝杆菌肺病组中32.7%的患者T-SPOT结果为阳性。NTM肺病组患者依从性相对较差，其中20例(27.8%)患者因为各种原因中断治疗。13.9%的NTM肺病患者初诊被误诊为肺结核。NTM肺病治疗时间长，其中38例(52.8%)治疗时间超过1年，24例(33.3%)超过2年。
　　结论：非结核分枝杆菌感染已经成为重要的公共卫生问题，目前关于NTM肺病主要存在诊断滞后、治疗周期长、复发率高、缺乏有效药物和依从性差等问题，需要引起广泛重视。