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株高是株型组成的关键性状之一,也是影响产量的重要因素。水稻第一次“绿色革命”得益于半矮秆基因Semi-dwarf（sd1）的使用,然而生产上过多使用sd1造成了遗传基础狭窄、产量瓶颈等问题。因此,明确sd1的作用机制,寻找更多株高基因具有重要的意义。前期研究显示,籼稻珍汕97（ZS97）中含缺失型sd1,株高呈现半矮秆,粳稻日本晴（NIP）品种含有功能型SD1株高也呈现半矮秆,但将NIP中功能型SD1导入ZS97中会使ZS97株高变高。为了解释这一现象,本研究利用NIP（半矮秆）和ZS97背景的近等基因系NIL-SD1NIP（高秆）构建分离群体,采用测序技术与混合分离分析（NGS-BSA）相结合的分析方法,寻找在SD1存在的条件下控制水稻株高变矮的位点,并对其中一个主效位点q PH8-1进行定位和转基因功能分析,主要结果如下:1. 利用NGS-BSA分析方法,检测到影响水稻株高的3个位点,分别位于第6染色体26.07-27.41 Mb、第8染色体8.92-11.79 Mb和14.76-15.58 Mb区间,分别命名为q PH6、q PH8-1、q PH8-2。3个QTL的统计G’值分别为5.44、6.38和5.16,其来源于NIP的等位基因均具有降低株高的效应。2. 针对q PH8-1,利用F2:3群体开展效应验证和精细定位。利用标记08C9110与08C9500筛选重组单株,并对重组单株加密标记,将q PH8-1定位在标记08C9260-08C9405之间的145 kb区间内。3. 利用NIP水稻功能基因注释网站对上述145 kb范围进行注释基因分析,该区段包含24个功能注释基因;序列分析显示,亲本NIP中的LOC＿08g15292（CYTB6）、LOC＿08g15322（CYTB559）、LOC＿08g15280（CYTF）这3个细胞色素基因在亲本ZS97缺失,因此认为这3个基因可能为q PH8-1的候选基因。4. 在ZS97背景的近等基因系NIL-SD1NIP中分别超表达NIP来源的CYTB6、CYTB559、CYTF,转基因株系均出现植株变矮的表型,表明CYTB6、CYTB559和CYTF负调控株高。5. 赤霉素（GA3）处理可以激活CYTB6、CYTB559、CYTF在苗期叶片中的表达;而多效唑（PBZ）处理能够抑制CYTB6、CYTB559、CYTF在苗期叶片中的表达,表明CYTB6、CYTB559、CYTF在GA合成中可能起反馈调控作用。