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孤独症是一种广泛发育障碍性疾病,以社会交往障碍、语言发育障碍、兴趣狭窄和刻板重复的行为方式为基本临床特征。孤独症被认为是儿童广泛性发育障碍(Pervasive developmental disorder, PDD)的一个亚型。阿斯伯格综合征(Asperger disorder, AS)、广泛性发育障碍未注明(PDD not otherwise specified, PDD-NOS)和儿童瓦解性精神障碍具有相似的临床特征而被归类为孤独症谱群疾病(ASD),他们均属于儿童广泛性发育障碍疾病。孤独症的病因学复杂,包括了遗传和环境的因素的影响,双生子和家系研究的结果显示遗传因素在孤独症的致病中起了重要作用,孤独症的遗传度高达80-90%。在中国人群中,孤独症患病率高达0.11%,中国人口数高达13亿,孤独症患者给社会造成极大的负担。因此,研究中国汉族人群的孤独症的病因具有重要意义。而突触在神经系统中具有重要作用,与突触结构功能相关的基因CNTNAP2,NRXN1和SHANK3可能与中国汉族人群的孤独症的易感性相关,因此有必要研究这三个基因是否为汉族人的孤独症的易感基因。方法：在采用芯片技术进行基因分型之前,我们采用PCR-RFLP技术对161个孤独症核心家系的CNTNAP2基因的三个SNPs位点进行了基因分型,并采用haploview4.1软件进行了家系为基础的传递不平衡检验。为进一步研究中国汉族儿童的CNTNAP2, NRXN1和SHANK3基因多态性与孤独症的相关性,采用Illumina CNV 370-Duo芯片对280个孤独症的核心家系人员,共455例孤独症患者及97例对照进行全基因组SNP分型。其余1000例对照来自安徽医科大学采用Illumina 610芯片进行基因分型的数据。从中选取CNTNAP2、NRXN1、SHANK3所有SNPs基因分型数据,采用haploview4.1软件进行家系为基础的传递不平衡检验和病例-对照关联分析,并分别构建单体型。结果：1、家系为基础的传递不平衡检验和病例-对照研究的结果均显示CNTNAP2基因的rs7785603,rs10085579,rs2972110位点与孤独症显著关联,这几个SNPs的一些单体型与孤独症的易感性相关。2、家系为基础的传递不平衡检验和病例-对照研究的结果均显示NRXN1基因的rs1518551,rs719645位点与孤独症显著关联,这几个SNPs的一些单体型与孤独症的易感性相关。3、家系为基础的传递不平衡检验和病例-对照研究的结果均显示SHANK3基因的rs8137951位点与孤独症显著关联,Block 2的GA、AG单体型与孤独症的易感性相关。结论：本研究结果显示CNTNAP2基因、NRXN1基因、SHANK3基因的遗传变异为中国汉族人孤独症的易感因素,研究结果支持CNTNAP2基因、NRXN1基因、SHANK3基因为孤独症易感基因。但考虑到孤独症这样的神经发育疾病的复杂性,及本研究相对较小的样本量和样本的遗传异质性,因此,有必要加大样本量对其进一步研究。