“大学自治”的理念在西方历史悠久,其涵义是大学作为一个法人团体,可以自由地治理学校、自主地处理学校的内部事务、最小限度地接受来自外界的干扰和支配。我国的公立大学依据法律规定也享有一定的自治权。但是由于“管理为重,权益为轻”的传统思想长期左右我国的教育立法,这样就放任了大学“家长式管理”做派,高校在行使自治权时侵犯学生权益的现象频频出现,而遭受高校权力侵害的学生因现行立法的空白,在寻求司法救济时又屡屡被“抛弃”,在倡导公民权利不容侵犯的当今社会,这种缺乏法治关爱的“真空地带”必须引起我们的高度关注。本文就是希望通过对大学自治权内部结构进行分析,梳理出行政权力和学术权力在校园中运行的基本轨迹,进而根据各自权力的特性及其对学生权益的影响,来探索如何对高校的自治权进行法律规制,以改变学生现在权利救济的困境。