根结线虫是线虫动物门(Nematoda或Nemata)的一小部分，属名Meliodogyne隶属于尾感器纲(Phasmida)、垫刃目(Tylenchida)、垫刃总科(Tylenehoidae)、异皮科(Heteroderidae)。它是严重制约世界农作物产量的重要病原线虫，种类繁多，寄主范围达2000多种植物。由于其适应范围广，传播途径多，尤其作为极难防治的土传性病害，对作物造成严重危害。云南省元谋地区作为主要的番茄种植及输出基地，每年由于番茄根结线虫病的危害造成了大量的产量损失。研究出快速检测番茄根结线虫病的方法可以为控制病害提供依据。 传统的线虫分类鉴定是根据线虫形态学，鉴别寄主反应及细胞遗传学等方法，但由于这些方法受到一定的局限而不能达到快速，准确鉴定的目的。生物体的线粒体DNA(mtDNA)在细胞中具有多拷贝，碱基序列比基因组小，典型的母性遗传方式和进化速率块的特点，是研究分类与进化的理想区域。由于mtDNA的COII和LrRNA基因间的序列相对保守，利用这个区域研究和鉴定的线虫种类是较快速和先进的方法。本研究采用同工酶电泳分析、mtDNA-PCR及RFLP分析，结合形态学(主要从会阴花纹方面)的方法，对云南元谋蔬菜种植基地番茄根系上采集的根结线虫进行种类鉴定和分子检测方法研究，取得主要研究结果如下： 1．通过对未纯化种群的mtDNA-PCR及RFLP分析，供试根结线虫可以被引物TRNAH和MRH106扩增，产生约557bp的片段。在通过限制性内切酶HinfI和MnlI分别对其进行酶切，分别产生约396bp、112bp、49bp和346bp、211bp的片段。参考JulieStanton，Andrew Hugall，Graig Moritz(1997)所做的研究，确定供试种群为南方根结线虫(M.incognita)。通过对4个纯化种群的同工酶分析(主要是酯酶和苹果酸脱氢酶)，发现4个种群的酯酶，苹果酸脱氢酶带型都一致。计算Rf值，四个种群酯酶谱带类型为I1,Rf值为0.47；苹果酸脱氢酶谱带类型为N1,Rf值为0.24。依据P.R.Esbenshade and A.C.Triantaphyllou，1990年建立的根结线虫酯酶和苹果酸脱氢酶电泳标准图谱，得出四个种群均为南方根结线虫。通过对4个纯化种群的形态学观察，包括测量其口针长，体长，及雌虫会阴花纹的制作和观察，发现供拭根结线虫的会阴花纹具有如下的一些共同特征：有明显的高而方的弓，线纹平滑至波浪状，侧面处有些分叉，但无明显的侧线，与报道描述的南方根结线虫相似。综合以上3种方法结果表明，云南元谋地区番茄病原根结线虫为南方根结线虫(M.incognita)。 2．以DNA为基础的分子诊断，可以克服不同虫态和发育阶段的影响，为线虫的准确，快速鉴定提供有效的途径。本研究通过对未纯化种群mtDNA的ORF和tRNAHis、1-rRNA和tRNAHis基因间序列的PCR扩增，并结合限制性内切酶HinfI和MnlI酶切，鉴定出供试种群为南方根结线虫，并用其他方法印证了该方法的可靠性。 3．试验中用分样筛法分离根结线虫的储存液，能将雌虫、2龄幼虫和虫卵很好的分开，分离效果达到90％以上。使用层析柱法能很好的将活跃2龄幼虫分离出来，从而为以后的接种鉴定及纯化培养提供了很好的基础。