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背景在全球范围内的HCV感染率约为2%,我国的感染率为0.43%。HCV慢性感染可导致肝脏慢性炎症坏死和纤维化,2%～4%的患者可发展为肝硬化和原发性肝细胞癌,这严重危害了患者的健康,已成为人们日益关注的社会和公共卫生问题。有研究表明,聚乙二醇化干扰素和利巴韦林联合治疗后,出现SVR的患者发生肝硬化和原发性肝细胞癌的时间推后,发生机率减少。但HCV的6个基因型对聚乙二醇化干扰素和利巴韦林联合治疗的敏感性和愈后均不同。因此,HCV基因型可以为选择个体最优的治疗方案和预测愈后提供依据。我国HCV高发人群主要为吸毒人群,感染率相对较低的人群包括：输血人群、肾透析人群、性病门诊人群和女性性工作者及其它哨点监测高危人群。了解HCV高危人群的HCV基因型分布信息可以为公共卫生投入和干预措施实施提供依据。目的获得中国部分地区吸毒人群和国家级哨点监测人群HCV感染者及医院就诊HCV患者的基因亚型信息；研究影响HCV基因型别分布的因素；分析静脉注射吸毒的危险因素；探讨抗体阳性结果与核酸阳性结果之间的关系；讨论HCV基线病毒载量值与感染HCV基因亚型的关系。方法1.根据中国区HCV的主要流行基因亚型,使用Premier5.0设计适合中国区HCV分子流行病学调查的通用型引物；2.使用国产酶联免疫试剂初筛,并采用进口酶联免疫试剂对S/CO比值大于0.8的样本进行复检,筛选得到HCV抗体阳性样本；3.利用MagNA Pure LC核酸自动提取仪提取HCV核酸后,进行NAT检测；4.NAT检测阳性样本经巢式RT-PCR扩增NS5B测序区段,阳性扩增产物送公司测序；5.采用Chromas Pro1.5、BioEdit和Mega4.0软件对基因序列进行清理、拼接、比对和系统进化分析；6.比较设计引物与HCV Database和《丙肝检测技术规范》推荐引物扩增已知基因亚型的样本核酸提取物的成功率；7.比较In-House方法和Abbott Real Time HCV Genotype Ⅱ检测HCV基因型的一致性；8.统计分析使用SAS9.1软件,采用的统计学方法包括：成组t检验,χ2检验,logistic回归和方差分析。结果1.1664份HCV抗体阳性样本来自吸毒人群和国家级哨点监测人群HCV感染者及医院就诊HCV患者。其中,1416份NAT检测阳性,1302份成功获取基因亚型信息(91.9%)。吸毒人群HCV感染者的主要基因亚型为：3a,3b和6a；国家级哨点检测人群HCV感染者和医院就诊HCV患者的主要基因亚型均为：1b和2a；2.HCV基因亚型分布在性别、年龄、地区和人群间分布差异存在统计学意义,不同地区及人群间影响HCV基因亚型分布因素不一致；3.男性、低年龄和已婚是静脉注射吸毒的危险因素；4.HCV基线病毒载量值在感染不同HCV基因亚型间分布差异无统计学意义；5.自行设计引物可以有效扩增中国区流行的7个基因亚型(1a,1b,2a,3a,3b,6a,6n), HCV Database推荐引物可以有效扩增1、2和3型；《丙肝检测技术规范》推荐引物可以有效扩增1和2型；6.18份样本(包括：1型,2型,3型和6型)使用In-House方法和Abbott Real Time HCV Genotype Ⅱ检测的基因型一致。1份In-house检测基因亚型为1a和3份6n亚型样本,雅培检测方法分别报告为1a/2混合感染和不确定；7. ELISA HCV抗体检测S/CO比值在HCV核酸阴性和阳性样本中分布差异不具有统计学差异。结论1.吸毒人群HCV感染者基因亚型以3型和6型为主,河北哨点监测人群HCV感染者和佑安医院就诊HCV患者基因亚型以1型和2型为主；2.性别、年龄、地区、人群和吸毒方式影响HCV基因亚型分布,不同地区及人群间影响HCV基因亚型分布因素不一致；3.男性、低年龄和已婚是静脉注射吸毒的危险因素；4.HCV基线病毒载量值在不同基因亚型感染者间分布无差异；5.自行设计引物能够有效扩增中国HCV流行的主要7个基因亚型(1a,1b,2a,3a,3b,6a,6n);6. Abbott Real time HCV Genotype与In-house方法检测HCV基因型的一致性较好；7.酶联免疫S/CO比值不能预测NAT检测结果。