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目的：应用蛋白组学技术分析新疆哈萨克族食管鳞状细胞癌和食管正常上皮组织的差异表达蛋白，为筛选哈萨克族食管鳞状细胞癌的分子标志物提供科学依据。 方法：选取新疆医科大学第一附属医院2011年新鲜手术切除哈萨克族食管鳞状细胞癌标本6例和相应的食管切缘正常粘膜组织，提取组织总蛋白，进行蛋白定量。应用双向凝胶电泳技术(2-DE)筛选差异强度>2倍的蛋白质点，基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)对差异蛋白点进行质谱分析，免疫组织化学检测差异蛋白HSP27在53例食管鳞状细胞癌和20例食管正常上皮组织中的表达水平，并分析HSP27与食管鳞状细胞癌临床病理特征之间的关系。 结果：(1)建立了新疆哈萨克族食管鳞状细胞癌组织和食管正常上皮组织的2-DE图谱。(2)获得43个差异蛋白点，其中有32个点在食管鳞状细胞癌组织中表达上调，11个点在食管正常组织中表达上调。质谱鉴定出22种蛋白，其中18种蛋白如S100A11、HSP27、14-3-3proteinσ、Enolase1、Transgelin等在食管鳞状细胞癌组织中表达明显增高，4种蛋白如SCCA1等在食管鳞状细胞癌组织中表达明显降低。(3)HSP27蛋白在食管鳞状细胞癌组织和食管正常上皮组织中阳性表达率分别为81.13％(43/53)、30.0%(6/20)，差异有统计学意义(χ2=17.203，P<0.000)。临床病理特征分析显示HSP27在食管鳞状细胞癌组织中的表达与肿瘤细胞分化有关(χ2=4.447，P<0.05)，与患者性别、年龄、民族、淋巴结转移和临床病理分期无关(P>0.05)。 结论：(1)22种差异蛋白可能与新疆哈萨克族食管鳞状细胞癌的发生和发展有关。(2)HSP27的表达与食管鳞状细胞癌的肿瘤分化程度有关，可能是食管鳞状细胞癌的预后分子标志物。