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粉虱传双生病毒病(Whitefly-transmitted geminiviruses,WTGVs)是世界多种经济作物生产上重要病害之一,已给39个国家的作物生产造成了严重损失。近年来在云南、海南、广东等局部地区持续流行,但在福建地区仅有发生烟草曲叶病毒的报道。田间调查发现,福建地区普遍存在的杂草赛葵(Malvastrum coromandelianum)表现出典型的双生病毒症状。经设计通用引物、PCR扩增、克隆和测序,首次从分子水平鉴定了杂草赛葵上的双生病毒。 从杂草赛葵上采集了2组病毒样本Fz1和Fs1,用双生病毒通用引物PA、PB对杂草样本进行特异性的PCR检测,结果发现:赛葵样本Fz1和Fs1都出现约500bp的条带,说明这些杂草赛葵上存在双生病毒。PCR产物测序进行序列比较发现:2组赛葵样本上病毒之间的差异极小,核苷酸序列同源性大约为96%,因此推测:这两组赛葵样本可能是由同一种病毒侵染。在此基础上,我们对赛葵Fz1样品中双生病毒的全基因组进行了研究。 对赛葵样本Fz1 DNA-A进行了克隆和序列测定,Fz1 DNA-A全长2741个核苷酸(nt)。Fz1 DNA-A基因组结构具有典型的粉虱传双生病毒特征:共编码6个开放阅读框(ORFs),其中病毒链编码AV1(CP)和AV2两个ORFs,互补链编码AC1(Rep)、AC2、AC3和ACA四个ORFs。经NCBI检索和序列比较分析发现,Fz1与广东番木瓜曲叶病毒分离物(PaCuLGDV-[GD2],AJ558122)的同源性最高,为86.14%,与中国番木瓜曲叶病毒(PaCuLCNV,AY650283)同源性次之,而与其它双生病毒的同源性均在83%以下。根据“双生病毒科病毒全基因组核苷酸序列同源性小于89%,往往定名为不同病毒;大于89%,则认为是同一病毒的不同株系”这一原则,Fz1为双生病毒的一种新种,根据病毒分类委员会命名原则,我们将该病毒命名为福建番木瓜曲叶病毒,英文名为Papaya culr leaf Fujian virus,简称PaCuLFJV。这是首次报道番木瓜曲叶病毒可以侵染杂草赛葵。