普通野生稻(O.rufipogonGriff.)是亚洲栽培稻(O.sativaL.)的祖先种，从野生稻中发掘栽培稻中已丢失或削弱了的优异基因，对我国水稻育种具有重要意义。本研究选用江西东乡野生稻为供体亲本、超高产籼稻品种“桂朝2号”为轮回亲本构建的一套265个系的渗入系群体，定位了野生稻与栽培稻种间杂种优势位点，分析了野生稻与栽培稻杂种优势的遗传基础，并对第2染色体上增产QTL(qGY2-1)进行了精细定位和遗传效应分析，旨在为我国水稻超高产育种提供新基因和杂种优势利用提供新的途径。主要结果如下： 1.通过对渗入系、渗入系与桂朝2号回交F1群体的基因型分析及产量性状中亲优势的调查，采用单标记分析法，定位了42个杂种优势位点(heteroticloci，HL)。其中，30个HL表现正的遗传效应，15个HL与栽培稻中已报道位点相同或相近，27个HL可能是野生稻所特有的或在进化的过程中丢失了。表明野生稻中分布着能产生杂种优势的位点，发掘和利用野生稻和栽培稻种间杂种优势对杂交稻育种具有重要意义。 2.在定位的杂种优势位点中，38个表现为超显性效应，4个表现为显性效应。表明在单位点水平上超显性是野生稻与栽培稻种间杂种优势的主要遗传基础。在42个杂种优势位点中，仅8个在渗入系表型QTL分析中检测到，杂种优势位点与渗入系表型QTL的遗传重叠率仅为19％，说明杂种优势与表型性状受不同位点控制。 3.利用染色体片段代换定位法，将来自东乡野生稻第2染色体上增产QTL(qGY2-1)精细定位在标记RM279与SBG1之间的102.9kb区域内。基因组分析发现，qGY2-1区域内包含了一个富含亮氨酸受体激酶(leucine-rich-repeatreceptorkinase，LRK)基因组成的基因簇，基因簇内表现出显著的等位基因变异。在桂朝2号和东乡野生稻中，LRK基因簇分别包含7个和8个串联排列的LRK基因拷贝，组成两个单倍型结构，两个单倍型区段所涉及的序列长度分别为43.9kb和52.6kb。进一步的表达分析发现，同一基因簇内的LRK基因有“加性”、“显性”、“超显性”等多种表达模式。通过单倍型区域等位基因结构和表达的变异分析，表明LRK基因簇是改良产量的候选基因。 4.来自东乡野生稻增产QTL(qGY2-1)在9311背景下，表现出了显著的增产效应。并且，部分大面积推广的杂交组合亲本在qGY2-1区域分属不同类型的单倍型，不同单倍型间能产生杂种优势。