深化医药卫生体制改革是世界性的难题，是人民群众最关心的社会热点问题之一，各国都经历了不同的改革阶段。公立医院在我国医疗服务体系中处于主导地位，是人民群众看病就医的主要场所，担当着为人民群众提供基本医疗卫生服务的重任，是体现政府公益性的主要载体。公立医院改革的成败直接关乎本轮深化医药卫生体制改革的成败。2010年，鄂尔多斯市被列为内蒙古自治区公立医院改革两个试点地区之一，最根本目的就是解决群众看病难、看病贵的问题，实现人人享有基本医疗卫生服务的目标要求。但是在政府财政投入有限、旧的体制机制难以打破的现实下，如何扭转公立医院的逐利行为，构建新的医疗秩序，回归公益性成了急需解决的难题。本文以公共产品、新公共管理、新公共服务理论为基础，从鄂尔多斯市公立医院改革现状入手，借鉴国内外公立医院改革理论研究和实践经验，在鄂尔多斯市公立医院改革所取得成绩基础上，进一步从公立医院公益性淡化、医疗资源配置不合理、基层医疗卫生机构服务能力差、基本医疗保障体系不健全、公立医院绩效考核缺失、公立医院的有效监管未建立等方面，分析了鄂尔多斯市公立医院改革中存在的问题及其原因。并针对上述问题从强化责任合理投入、优化布局合理配置、深化公立医院体制机制改革、建立完善公立医院绩效考评体系、建立有效的医保控费机制这五个方面为鄂尔多斯市公立医院未来改革提出了建议。