Stenotrophomonas maltophilia DHHJ突变体库的构建与降解角蛋白相关基因筛选

来源 :东华大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:sunjava2009
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动物羽毛和皮毛等被作为废弃物丢弃,既造成环境污染,又会危害人类健康。角蛋白在羽毛中占了很大比例,适当处理后的产物如氨基酸等有很大用途,如在农业饲料、化妆品原料等的应用。采用微生物的方法降解角蛋白,既能减少了蛋白质变性与氨基酸的损失,又能提高了羽毛粉利用率,使羽毛粉的营养价值显著提高,所获得的经济收益更高,又会产生更多的副产品。
  目前人们对羽毛角蛋白这种资源的研究多集中在角蛋白降解菌的分离鉴定、角蛋白酶的研究等方面,但关于降解机理鲜有报道。突变体为代表的正向遗传分析是了解代谢途径的有效方法,而缺乏高效可靠突变体筛选方法是该方案在角蛋白降解机制分析应用较少的主要原因,目前采取酶活方法来决定角蛋白降解能力,费时费力,难以用于大规模筛选。对此,本论文建立了一种用于筛选不同角蛋白降解能力微生物的筛选体系,并利用该体系分析由 mini Tn10 构建的S.maltophinia DHHJ突变体库,筛选结果与酶活测定结果完全一致。为寻找与角蛋白降解相关基因奠定了基础。
  S.maltophilia DHHJ 对卡那霉素、氨苄青霉素抗性不敏感,对氯霉素敏感,因此,选用氯霉素抗性作为突变体筛选标记。利用携带mini-Tn10 转座酶和卡那霉素抗性转座质粒 pNKBOR 和含氯霉素抗性基因的 pTUCm 质粒,用氯霉素抗性基因置换pNKBOR质粒的卡那霉素抗性基因,构建了以氯霉素抗性作为选择标记的转座质粒pNKCM 转座子。之后利用电转化方法,构建了嗜麦芽窄食单胞菌(Stenotrophomonas maltophilia)DHHJ的插入突变体库。随后,对突变体库进行阳性分子鉴定,随机挑选了6个突变体,以其基因组DNA为模板,用扩增氯霉素抗性基因的引物对其进行 PCR 扩增,结果所有的插入突变体均能扩增到约 850bp 的目标条带,而野生型无该条带,说明得到的突变体是转座子插入突变体。本论文利用这个方法一共得到1200个S.maltophilia DHHJ转座子插入突变体,转化效率是206 cfu/ng。
  利用建立的筛选体系对菌株进行筛选,两轮筛选后,共鉴定出6株角蛋白降解能力减弱的突变体,通过测酶活的方法再一次对筛选结果验证,两者结果100%一致。在获得突变体后,利用TAIL-PCR的方法获得插入位点的侧翼序列。在 S2 菌株中,pNKCM 转座子插入位点是一个跨膜转运蛋白基因(1401),编码MFS转运蛋白,转座子插入到其483位。
  本论文研究结果对探究角蛋白降解菌利用角蛋白的分子机制奠定基础。
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