本研究采用RAPD技术对100份枇杷小种子植株个体材料、1份母株材料以及1份母株砧木材料进行变异性和遗传多样性分析。首先对枇杷基因组DNA的提取方法进行了改良,以获得高质量的基因组DNA,用于RAPD分析。然后对枇杷RAPD反应体系体系进行优化,建立最佳RAPD扩增体系,筛选出适合枇杷RAPD分析的随机引物并进行PCR扩增。对样品的RAPD图谱及数据进行统计分析。研究结果如下:（1）本试验采用改良CTAB法,成功地从新鲜和硅胶保存的枇杷嫩叶中提取DNA,产率较高,OD₂₆₀/OD₂₈₀为1.80—2.05范围内,符合RAPD分析的要求。通过琼脂糖凝胶电泳分析,提取的DNA质量高,完整性好。（2）优化了枇杷RAPD最佳反应体系:PCR扩增的总体积为25μL,包括50ng的模板DNA,10×PCR buffer 2.5μL,2.0mmol/L MgCl₂,0.2mmol/L dNTP,0.3μmol/L引物,Taq酶1.2U。扩增程序为:94℃预变性4min,94℃变性1min,38℃退火1.5min,72℃2min,45个循环后在72℃延伸10 min,结束后在4℃条件下保存。最后用2.0%的琼脂糖凝胶电泳检测其扩增产物。（3）采用优化后的反应体系对120个引物进行筛选,经过三次重复,筛选出多态性和扩增重复性好、谱带清晰且较多的9个引物。（4）利用9个筛选出的RAPD引物对枇杷小种子植株群体、母株及其砧木材料进行扩增,研究群体的遗传多样性。共产生100条谱带,其中83条为多态性带,占83%,平均每个引物扩增的DNA带数为11.11条,多态性带9.22条。根据扩增结果建立了个体间亲缘关系的UPGMA聚类图,将102份单株划分为5大类。（5）通过POPGENE32 1.32软件的分析,获得了枇杷小种子植株群体Nei基因多样度指数和Shannon多样性信息含量指数。枇杷小种子植株群体内遗传多样性较高,同时,存在大量的变异单株,为枇杷选育种提供了丰富的原材料,为后续研究奠定了基础。（6）分析了枇杷小种子植株材料的分子性状,发现多份单株具有各自的特异性谱带,4号在s273-250、34号在s22-600、49号在s285-900、61号在s1002-200、63号在s22-250、75号在s1002-600、88号在s22-1400处分别有各自的特异分子标记。可作为这些单株今后成为新品种或株系的分子指纹标记。