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萱草属(Hemerocallisfulva)植物种质资源丰富，分布广泛，品种繁多，且应用价值很大。本实验采用ISSR标记技术，研究萱草属植物的遗传多样性并构建指纹图谱。实验结果如下：1．通过ISSR-PCR技术对3个原始种及97个栽培种共100种萱草属植物的亲缘关系及遗传多样性进行分析；采用改良CTAB法提取基因组DNA，建立了萱草属植物ISSR-PCR最佳反应体系，该体系为：25μl体系中DNA模板1.5μl，引物1.0μl，Taq DNA聚合酶0.2μl，dNTP1.5μl，10×PCR buffer2.5μl，ddH2O18.3μl；并从100条引物中筛选出12条扩增效果较好的引物，确定了各引物的最适退火温度，12条引物共扩增出144条条带，其中多态性条带140条，多态性百分比（PPB）达到97.22%，证明实验所选材料具有很好的遗传多样性。2．利用PopGene软件对实验结果进行分析，结果表明：100份供试样品间有效等位基因数(ne)为1.8565，Nei’s遗传多样性指数(he)为0.4557，shannon’s信息指数（I）为0.6466，遗传距离在0.0946-0.6523之间，表明所选材料的基因覆盖率较广、种间变异较大；NTSYS软件聚类分析结果显示在遗传多样性系数为0.69时供试样品聚为3类，第一类为编号1-18、20-31、33-50的样品，第二类为编号32、51-100的样品，第三类为编号19的样品。聚类结果分析表明：H.LittleBusiness、H.Foshou、H.BuffyisDoll、H.DaringDeception、 H.Zhujin、 H.RosyReturn应属于大花萱草（HmiddendorfiiTrautv.etMey.）；H.Chaoyang应为北黄花菜（H.lilio-asphodelusL）的杂交种。3．实验所用的两种原始种萱草（H.fulvaL）及北黄花菜（H.lilio-asphodelusL）未聚为一类，该结果与熊治延等人、朱华芳等人及黎海利等人的研究结果相同，但与朱云华等人的研究结果不同，分析应与实验材料来源及所用引物不同有关。