制药企业是国民经济的重要组成部分,其对国家、社会乃至生态环境都具有重大影响,国家对很多项目都给予一定的扶持。从而,制药企业在面对多个项目选择时,具有自身的特点,其在考虑项目成本、利润、风险等时,还需要考虑其他方面比如社会效益,国家政策等。笔者通过大量的文献调查分析和实践的基础上,并结合头脑风暴法,整理得出制药企业在项目评价过程中应该关注的指标,建立了一个二级指标评价体系；为获得,每个指标的权重,建立层次分析模型,利用专家的打分,建立成对比较矩阵,从而计算得出每个指标的权重,完成了评价指标体系的建立。指标体系建立后,笔者将每个指标均划分为五个等级,结合定量指标与定性指标的特点分别采取不同的模糊评价方法,通过隶属函数将各指标转换为指标等级概率,然后结合每个指标的权重获得每个指标的值,并获得项目综合评价值。最后,本文结合某一制药企业的案例,对本文的项目评估过程及计算过程做了具体的说明。