本文源于导师的湖南省科技厅重点项目“泛珠三角区域科技合作机制创新研究”(项目编号:2009WK3003)中的子项目。　　 本文从现有文献中引申出科技资源配置效率在狭义和广义上的定义,狭义上的定义是指科技资源实际配置状况与理想的最优配置状况的比值或差值,广义上的定义又分为两种,从静态上应理解为科技活动中科技产出与科技投入的比值,从动态上应理解为科技投入对科技产出的弹性,即科技产出变化值与科技投入变化值之比。从科技资源配置体系结构出发,从科技资源配置主体、客体和机制三方面对泛珠三角区域科技资源配置的现状进行说明,泛珠三角区域企业、高校和科研机构三个配置主体以及科技人力资源和科技财力资源两个配置客体的地区分布不均衡,科技合作协议等制度有利于区域的科技资源配置优化和效率的提升。构建衡量科技资源配置效率的指标体系,利用泛珠三角区域1999.2007年的科技资源数据,基于数据包络分析方法,选取C2R模型和C2GS2模型,从科技资源配置效率狭义上的解释进行实证分析,发现由于科技人力和财力资源地区分布不均、人力资源流动性差、人才密度低、科技经费利用不合理和科技经费投入强度低等原因,造成科技人力和财力资源投入配置不合理,导致泛珠三角区域整体科技资源配置效率偏低;基于典型相关分析方法,选取效率测度模型,从科技资源配置效率广义动态上的解释对泛珠三角区域进行实证分析,发现由于科技经费投入不足、科技经费配置不合理和科技人员缺乏流动性等原因,造成科技人员全时当量和科技经费内部支出对科技产出的弹性较小,从整体上看泛珠三角区域科技资源配置效率仍然偏低;基于以上两种分析方法,选取比较对象,将泛珠三角区域科技资源配置效率与长三角区域和环渤海区域进行比较分析,发现无论从科技资源配置效率狭义还是广义上的解释,泛珠三角区域科技资源配置效率都处于三个区域的最低位置。本文为泛珠三角区域科技资源配置效率的提高提出加大对落后地区的教育投资,促进科技人员合理流动,加强国内外科技合作,培养和吸引优秀科技人才,加强区域内科技合作,合理利用科技经费,加大科技经费投入力度,优先R&D经费投入等政策建议。