癌症中TP53变异的研究

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目的:肿瘤抑制基因TP53的突变是许多癌症发生发展的重要危险因素之一,本次研究通过观察TP53在癌症中突变的普遍规律及个别癌症中的突变特征,探寻TP53突变在不同癌症中的相互关系。  方法:通过IARC TP53 Database数据库中的TP53突变数据统计,对TP53突变位点,碱基置换,氨基酸置换,二级结构中突变及氨基酸置换变异率进行统计分析。  结论:  1.癌症中TP53突变高发位点都集中在175,248和273热点上,不同癌症高发的位点不同,肺癌中较为特殊的热点为157和158。  2.大多数癌症最为高发的碱基置换为CpG处的G:C>A:T置换,肝癌和肺癌以G:C>T:A置换最多见。  3.在所有癌症中,以精氨酸>组氨酸最为常见,同时发生突变最多的氨基酸为精氨酸,除了肝癌中最易突变成丝氨酸外,其他大多数癌症突变形成最多的为组氨酸及半胱氨酸。氨基酸分类后,最常见的突变为疏水氨基酸>疏水氨基酸。  4.在二级结构中发生的突变占总体的68%。  5.大多数癌症高发的突变为:R175H、R248W、R248Q、R273C、R273H、R282W。个别癌症较有特异性的突变:R249S--肝癌;G245S--结直肠癌;C176F--食管癌;R280T、E285K--膀胱癌;Y220C、I195T--卵巢癌;V157F、R158L、R273L、R248L--肺癌;G245C--肺癌和头颈部癌。  6.在聚类分析及相关性分析中发现,结直肠癌和脑恶性胶质瘤在某些突变分析中存在一定相似性,肝癌和肺癌在TP53突变中有着较为明显的特征。
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