分子生物学研究生物大分子(基因与蛋白)的结构与功能，是阐明生命现象本质的科学。应用计算机技术对分子生物学实验所产生的海量数据进行采集、表达、描述、储存和分析，推动了生物信息学这一新兴学科的发展，带动了包括数据库、数据发掘、人工智能、算法、图形计算、软件工程等在内的计算机科学的大部分领域在生物信息学中的研究。空间环境诱变水稻的研究是在生物信息学范畴内，基于当今日渐成熟的太空技术而展开的，主要用来研究空间环境对水稻种子的基因所造成的各种影响。本文所研究内容来源于国家863高技术研究发展计划“生物和农业技术领域生物信息技术”主题的“空间生物信息获取与分析技术”课题。 本文首先对空间环境诱变水稻信息获取源进行了分析，确定了所要处理的四部分数据，包括水稻种质和诱变环境数据、田间实验数据、蛋白质组实验数据及基因组实验数据。根据对各部分数据的分析，建立了合理的关系数据模型，实现了数据的效存储，并为下一步的多维数掘模型的建立奠定了基础。之后在所建立的数据库基础上完成了空间环境诱变水稻数据库应用系统的开发，将示例信息和数据进行录入，并根据应用需求对蛋白质组实验的部分数据进行统计。最后根据基因与表型及蛋白与表型间的关系，建立多维数据模型，并使用数据分析与挖掘工具根据所建立的模型进行多维数据分析，分析的结果表明应用所建立的模型可以从不同的角度展示基因信息与表型、蛋白质信息与表型之间的关系，为空间环境诱变水稻研究提供强有力的支持。 利用空间环境对水稻种子进行诱变，应用现代生物学和生物信息技术，对分子水平上获得的数据进行分析和处理，对指导水稻种子受空间条件影响而产生的突变情况进行研究具有十分重要的意义。