灰霉病菌多重抗性检测的悬浮芯片技术的优化及应用

来源 :北京工业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:comeon833833
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
灰霉病是一类严重的植物病害,对于灰霉的防治主要依赖于化学杀菌剂。由于不合理的施药方法,导致灰霉对多种常规杀菌剂产生了抗药性。因此急需一种对于田间抗药菌株进行高通量,多抗药相关位点检测的方法。而本实验室前期初步建立了悬浮芯片技术,能够检测4个抗药相关基因的8种基因型,有些常见位点不能检测。本研究增加悬浮芯片法的检测位点数量并对方法进行优化,并且应用悬浮芯片技术检测河北省地区的田间菌株,对指导田间施药有重要的意义。本研究的主要结果如下:(1)灰霉耐药基因位点悬浮芯片法优化。在本课题前期建立的检测4个抗药相关基因的8种基因型方法的基础上,本研究通过TAG-ASPE引物的筛选,反应条件的优化,成功的在悬浮芯片法中添加了10种新的基因型,使得可测的基因型增至18种,即:Ben A-E198(GAG)、Ben A-E198A(GCG)、Ben A-E198V(GTG)、Ben A-E198K(AAG)、Ben A-F200(TTC)、Ben A-F200Y(TAC)、Sdh B-H272(CAC)、Sdh B-H272R(TCG)、Sdh B-H272Y(TAC)、Bc OS1-I365(ATC)、Bc OS1-I365N(AAC)、Bc OS1-I365S(AGC)、Bc OS1-Q369(CAG)、Bc OS1-Q369P(CCG)、Bc OS1-N373(AAC)、Bc OS1-N373S(AGC)、erg27-F412(TTC)、erg27-F412S(TCC)。经过优化的悬浮芯片法能较全面的涵盖常用杀菌剂抗性相关的基因型,能为田间灰霉病菌的多重抗性快速监测提供技术平台。(2)灰霉耐药基因位点悬浮芯片法应用河北省地区的田间菌株的检测。通过悬浮芯片法对2016至2017年间河北省地区103株菌株进行了检测,结果显示Ben A、Sdh B、Bc OS1、erg27基因的抗性频率分别为100%、4.85%、75.73%、0%。高达98.06%的菌株具有多重抗药性,其中具有双重、三重、四重抗性的菌株频率分别为13.59%、83.50%、0.97%,且具有三重抗性的type X(CarRDieRBosSIprRFenS)菌株数量最多。这说明河北省地区多重抗性情况已比较严重。(3)灰霉耐药基因位点悬浮芯片法与菌丝生长速率法的比较。为了更合理的指导田间施药,除分子法外,本文还结合了菌丝生长速率法来测试菌株的敏感性。携带着Ben A-E198A/K/V突变的菌株对多菌灵是高抗,而一株Ben A-F200Y突变菌株则是中抗。Ben A-E198K突变对乙霉威具有十分高的抗性,Ben A-E198V突变对乙霉威具有中抗和高抗。H272R菌株对啶酰菌胺是低抗。所有异菌脲抗性的菌株均为低抗和中抗。此外,通过比较2016年间至2017年间不同基因型菌株抗药水平的变化发现,在持续用药的情况下,菌株对相应药物的EC50值会有显著的上升,如Ben A-E198K/V、Bc OS1-I365S和Bc OS1-Q369P+N373S。因此,在该地区不推荐使用多菌灵,且乙霉威、异菌脲和啶酰菌胺的使用需要更加慎重。由于分子法结果中未测到erg27基因的抗性突变,环酰菌胺抑制灰霉病可以作为该地区的一种选择。综上所述,本研究建立了更高通量灰霉耐药基因位点悬浮芯片法检测技术,可以同时对4个抗药相关基因的18种基因型进行分析。该方法为指导田间用药和监测耐药性突变提供了技术支撑。
其他文献
大型空腔叶片作为舰船动力系统中过流的关键部件,其精度和性能的要求标准较高,为了消除内应力和改善金属材料的性能,对铸造得到的大型空腔叶片进行热处理工艺。由于叶片含有极为复杂的复合型面,并且具有内空腔、大曲率及长翼型的独特结构,在进行热处理工艺时产生一定程度的变形,影响大型空腔叶片的使用性能。因此,大型空腔叶片热处理前后的数字化测量及评定过程有着重要的实际意义。本文以热处理前后的大型空腔叶片为对象,研
目的:运用基于二维斑点追踪成像(two-dimensional speckle tracking imaging,2D-STI)技术的自动功能成像(automatic functional imaging,AFI)技术评价常规超声心动图未发现明显节段性室壁运动异常(regional wall motion abnormality,RWMA)的冠心病患者左室心肌力学改变特性,并探讨其与冠状动脉狭窄程
骨骼肌受神经系统的支配,表现出独特的力学性质和主动吸能特性,在人体运动冲击过程中起良好的缓冲保护作用。研究资料表明,国内外学者对离体肌肉的动静态拉伸压缩力学性质的
在党的第十九次全国代表大会上,习近平总书记强调指出,推进全面从严治党向纵深延伸,要坚持加强党的基层组织建设,坚持“以提升组织力为重点”,把基层党组织锻造成为我们党坚强的“战斗堡垒”。这是新时代党中央对基层党组织的新定位,也是新时代加强基层党建工作的着力点。自中国共产党成立以来,我们党就高度重视对基层党组织的建设,逐步从中央到地方形成了一套系统化的党组织管理体系,为党组织组织力的发挥奠定了坚实的基础
自平衡控制问题是非线性动态系统控制中的一个经典问题,有着悠久的研究历史。作为控制领域研究的热点,自平衡装置被公认为是自动控制理论中理想的典型实验设备。目前,对于平衡控制的研究主要集中于直线倒立摆或者是单轴的惯性轮倒立摆,对三维的空间倒立摆的研究很少,特别是其控制方法的研究还处于初级阶段,有待进一步深入探索和研究。立方体机器人是一种基于惯性轮组的三维倒立摆,基于惯性轮组产生的反作用力矩使其可以在边线
铜合金是当前除了钢铁、铝合金之外最重要的金属种类,因其具有良好特性而被广泛应用于各个行业、领域。在工作过程中,铜合金表面往往要承受较大的冲击力与摩擦力,造成铜基表面磨损,严重影响零件的工作性能和使用寿命,致使能源和材料的浪费。本文对铜基表面的耐磨性进行研究,以仿生学原理为依据,探究电沉积、等离子喷涂两种制备工艺的工艺参数对耐磨性的影响,分析耐磨涂层性能并确定最优制备工艺,对于提高铜基表面耐磨性具有
本文以植物致病性细菌为研究对象,根据活性拼接原理,在苯并噻唑C-2位引入酰腙和双亚砜活性基团,设计合成了24个含酰腙和双亚砜结构的新型苯并噻唑衍生物。采用浑浊度法测试目标化合物对水稻白叶枯细菌(Xanthomonas oryzae pv.oryzae(Xoo))和柑橘溃疡病菌(Xanthomonas oryzae pv.oryzicola(Xac))的离体抑菌活性。另外,通过活体盆栽实验测试化合物
集成柔性传感器的电子皮肤可模仿人类皮肤,感知各种环境刺激,在可穿戴健康监测、机器人皮肤等高端领域的应用前景十分广阔,受到科研人员的密切关注。目前,柔性传感器主要通过物理接触引起自身形变,实现对应力、应变以及压力等的传感,获取环境信息。然而,这些传感器在经历重复形变后,器件材料易出现疲劳,内部结构发生改变或损坏,造成器件响应性能的失稳和劣化。接近式的非接触传感器可感知被测导体与传感器间的距离就,不仅
含氮有机配体的配位聚合物具有迷人的晶体结构以及丰富多彩的结构单元,不同的结构单元具有不同的特点,这样导致了其具有不同的物理化学性质,因此,含氮的配位聚合物具有广泛的
目的:采用回顾性队列研究的方法,对广东省中医院于2011-2016年住院诊断为糖尿病肾病患者病例资料进行整理分析,探讨在中医治疗下影响糖尿病肾病肾功能进展的风险因素及影响预后的风险因素,分别构建糖尿病肾病患者肾功能进展的预测方程及预测糖尿病肾病患者预后的列线图。方法:①收集广东省中医院住院系统中于2011-2016年住院诊断为糖尿病肾病的患者的病例资料,选出治疗过程使用中医进行干预治疗且诊断糖尿病