目的：　　1.调查温州地区2014~2016年疑似由非结核分枝杆菌（NTM）引起感染的流行情况，以及相关因素的分析。　　2.比较NTM不同鉴定方法DNA微阵列芯片技术与基质辅助激光解析电离飞行时间质谱（MALDI-TOF MS）在菌种鉴定上的差异，为临床快速诊断NTM提供实验室基础。　　方法：　　1.从2014年1月1日起到2016年12月31日止，对温州地区所有分枝杆菌培养阳性的患者资料进行统计分析；应用BACTEC?MGIT960对分枝杆菌进行液体培养，PNA/TCH鉴别培养基对NTM进行初步鉴定；应用基因芯片法对2016年分离到的90株初步鉴定为NTM的细菌进行菌种鉴定。　　2.应用BACTEC?MGIT960液体培养法对2016年保存的NTM菌株进行复苏，剔除污染及未生长NTM菌株，共74株；分别应用基因芯片法、MALDI-TOF MS与16s rRNA测序对74株NTM进行菌种鉴定；以16s rRNA测序作为参考方法分析比较基因芯片法与MALDI-TOF MS鉴定结果的差异，评价两种方法的优劣势。　　结果：　　1.2014～2016年温州地区分枝杆菌培养阳性患者病例3691例，分离得到NTM269株，总分离率为7.3%；温州市中心医院共检出分枝杆菌1318株，NTM206株，分离率15.6%；各区/县定点医院共检出分枝杆菌2373株，NTM63株，分离率为2.7%；三年来NTM分离率分别为2014年7.0%，2015年为7.2%，2016年为7.7%呈逐年上升趋势。269例NTM感染患者男性141例，女性128例，男女比例为1.1:1，女性患者人数呈上升趋势；年龄分布从19～90岁，45岁以上患者占83.3%，45～74岁患者占62.8%，男性以45～59岁、女性以60～74岁年龄段为分离高峰。鹿城区是NTM分离率最高的地区，占32.3%，瓯海区（14.1%）与永嘉县（12.6%）次之，鹿城区女性患者多于男性，男女比例为1:1.4。2016年分离到的90株NTM菌株经基因芯片法鉴定发现2株为结核分枝杆菌复合群（MTC），其余88株NTM以胞内分枝杆（52.3%）、鸟分枝杆菌（21.6%）与龟/脓肿分枝杆菌复合群（17.1%）为主。　　2.通过16s rRNA测序，74株NTM鉴定结果：胞内分枝杆菌37株，脓肿分枝杆菌19株，马赛/莲建分枝杆菌7株，鸟分枝杆菌5株，堪萨斯/胃分枝杆菌2株，海分枝杆菌1株，猪分枝杆菌1株，哥伦比亚分枝杆菌1株，奇美拉分枝杆菌1株。基因芯片法与MALDI-TOF MS质谱法的鉴定结果与16s rRNA相比，有14株存在争议性：基因芯片法与16s rRNA测序有12株结果不同，准确率为83.8%，鉴定到复合群准确率为95.9%；质谱鉴定有2株未给出结果，与16s rRNA测序有7株结果不同，准确率为87.8%，鉴定到复合群准确率为97.3%。在时间成本上，质谱法鉴定74个样本需要2-3h，基因芯片法需要2d。　　结论：　　1.温州地区2014~2016年来NTM分离率呈逐年上升趋势，2016年分离率为7.7%；分离患者男性稍多女性，比例接近于1:1，女性患者人数呈上升趋势；分离患者以中老年患者为主，男性患者年龄较女性患者年轻；鹿城区是NTM分离率最高的地区，且女性患者多于男性；2016年分离到的90株NTM，除2株为结合分枝杆菌复合群外，NTM菌种分布以胞内分枝杆菌、鸟分枝杆菌与龟/脓肿分枝杆菌复合群为主。　　2.与16s rRNA测序相比，基因芯片法与MALDI-TOF MS对NTM鉴定到种的符合率分别为83.8%与87.8%，鉴定到复合群的符合率分别为95.9%与97.3%，质谱法略高于芯片法，两者鉴定到复合群的符合率均在95%以上，展现两种方法在NTM菌种鉴定上优异的性能。质谱法能鉴定一部分高度同源性菌种，如鸟/胞内复合群的能力要优于芯片法，时间成本上也更合理，但目前质谱需要对培养后的菌落进行鉴定，基因芯片法目前可以用于直接检测标本中的分枝杆菌，有其独特的优势，对分枝杆菌感染的快速诊断上有重要的临床意义。随着飞行时间质谱仪在各微生物实验室的逐渐普及，质谱技术以准确、高效的鉴定效率与低廉的鉴定成本在临床快速鉴定NTM菌种方面有着良好的应用前景，用于直接样本检测的应用也在不断发展；基因芯片技术也在不断发展，两种方法都能为临床更快速准确鉴定NTM提供支持。