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植原体病害是一种世界范围的植物病害,已经对我国经济作物产生重大危害,海南省植物种类资源丰富、温度适宜,所以海南是植原体病害的适发区,部分植原体病害已经严重为害海南的槟榔等产业的发展。本研究鉴定出四种海南新发生植原体病害病原,并分析了病原植原体相关基因的功能。主要结果如下：本研究使用植原体的通用引物对R16mF2/R16mR1和R16F2n/R16R2,对采自海南岛内7个地区的疑似感染植原体的23个样品进行巢式PCR扩增,结果鉴定出海南新发生的四种植原体病害,分别是辣椒小叶病植原体(HoPLL)、胡椒黄化病植原体(PepY)、假花生黄化病植原体(DeHY)和木薯丛枝病植原体(CasWB).其中辣椒小叶病植原体(HoPLL)、木薯丛枝病植原体(CasWB)、假花生黄化病植原体(DeHY)的16S rDNA序列均为1248bp,胡椒黄化病植原体(PepY)的16S rDNA序列为1246bp,G+C含量的范围为46.95%-47.60%,通过对其16S rDNA序列构建进化树及iPhyClassifier分析,确定辣椒小叶病植原体(HoPLL)、木薯丛枝病植原体(CasWB)、假花生黄化病植原体(DeHY)属于16SrII-A亚组、胡椒黄化病植原体(PepY)属于16SrI-B亚组。本研究首次测定了我国长春花小叶病植原体质粒pPLLHn-1的完整DNA序列,全长4102bp(GenBank登录号：JN835187),G+C含量为24.82%,pPLLHn-1编码5个蛋白。使用生物信息学软件分析得出：ORF2、ORF4编码的蛋白分别含有两个个疏水跨膜区,推测这些蛋白定位在细胞膜上；ORF3的信号肽信号值为0.948,ORF3编码的氨基酸序列与洋葱黄化植原体质粒pEcOYW1参与质粒拷贝数控制的蛋白具有97%的同源性,并且根据分泌蛋白的特征分析初步推断ORF3蛋白为分泌蛋白。研究还发现,SSB蛋白比RepA蛋白更为保守；RepA蛋白变异虽然较大,但是却存在极高度保守的功能基序。本研究成功将pPLLHn-1ORF3、pPLLHn-1ORF4基因进行克隆,并构建表达载体PBI121-pPLLHn1ORF3。本研究测定了长春花小叶病植原体secA基因2523bp,编码556个氨基酸；长春花小叶病植原体secY基因1255bp,编码413个氨基酸；长春花黄化病植原体secA基因836bp,编码277个氨基酸；长春花黄化病植原体secY基因1417bp,包含secY-1(?)(?)secY-2基因,分别编码299个氨基酸和104个氨基酸,并且这两个基因为非重叠基因。通过序列同源性比较,结果表明长春花小叶植原体海南株系属于16SrI-B亚组,长春花黄化植原体海南株系属于16SrV组。从亚组的水平上确定了长春花小叶病植原体的分类地位,从组的水平上确定了长春花黄化病植原体的分类地位。用TMPred程序预测长春花小叶病植原体secY蛋白含有9个跨膜区,预测长春花黄化病植原体secY蛋白含有5个跨膜区,推测这些蛋白定位在细胞膜上,进行转运分泌蛋白,进而参与与宿主植物互作。