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本论文以安琪酵母股份有限公司有代表性的酿酒酵母属中24株酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)及相关3种子囊菌酵母为研究对象,通过对所选取酵母菌株的核糖体DNA(rDNA) ITS-1序列进行电泳和克隆测序,分析出它们之间的系统学关系。研究表明,以酵母菌株的rDNA ITS-1序列进行琼脂糖凝胶电泳,能把菌株分类鉴定到属的水平;采用非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳能把部分酿酒酵母菌株分类鉴定到种的水平,区别效果较琼脂糖凝胶电泳有所提高;对rDNA ITS-1序列进行克隆、测序,经序列比对后发现,酿酒酵母属中酿酒酵母菌株的ITS-1序列大多数有差异,差异主要表现在ITS-1序列上游的一段Poly-T碱基上,其它处的差异仅是个别碱基的转换或颠换,ITS-1序列长度分布在360-370bp之间,G+C%含量均在35.3%左右。所有序列不同的菌株的ITS-1序列在GenBank上发布,并在NCBI上做BLUST比较,最后鉴定出一株酵母菌不属于酿酒酵母,结合序列比对和进化树分析,确认它属于葡萄汁酵母(Saccharomyces uvarum)。根据酿酒酵母ITS-1序列的不同,用ClustalX1.8、Phylip3.6等生物软件做进化树分析和系统分类学研究,最后确定了各菌株之间的亲缘关系远近。实验结果也证明ITS-1序列分析方法在酵母公司生产酵母及其发酵生产过程中的应用可行性及其重要作用。用形态特征观察和生理生化测定等常规分类学方法进行酵母菌株的分类鉴定,一般只能分类到属的水平,而且花费的周期长,容易出现分类学上的混乱,导致系统分类的不稳定,常常会给生产上带来很大的障碍,引起巨大的经济损失。近年来,随着生物化学和分子生物学的快速发展,一些分子生物学方法逐渐应用到酵母等真菌及细菌的系统分类学中,从而简化了过去一些复杂的鉴定程序,使各种菌种的系统学地位得到改进和明确,在生产上的应用价值也大大提高。