目的:通过生物信息学方法筛选胆管癌的潜在生物学标记,为胆管癌早期诊断、治疗及预后提供可能靶点。方法:从高通量基因表达数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)中下载胆管癌的3个基因芯片数据集及3个Micro RNA芯片数据集并筛选得到差异表达基因(Differentially expressed genes,DEGs)及差异表达微小核糖核酸(differentially expressed Micro RNAs,DEMs)。利用生物信息数据库DAVIA(Database for Annotation,Visualization and Integrated Discovery)对DEGs进行基因本体(gene ontology,GO)注释及KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)通路分析。进一步构建DEGs的蛋白互作网络(proteinprotein interaction network,PPI)并筛选核心网络。通过软件预测DEMs的靶基因并与DEGs取交集后得到核心基因及与其对应的Micro RNA。通过基因表达谱交互分析数据库(Gene Expression Profiling Interactive Analysis,GEPIA)及在线工具Oncomi R分别对核心基因及相关Micro RNA进行表达谱分析及生存分析。结果:通过筛选获得152个DEGs及2个DEMs。GO注释及KEGG通路分析分析显示DEGs富集于外源生物代谢过程(xenobiotic metabolic processes)、脂质转运与环氧合酶P450(lipid transport and epoxygenase P450)、化学致癌作用(chemical carcinogenesis)及氨基酸的生物合成与PPAR信号转导(biosynthesis of amino acids and PPAR signaling)。核心PPI共包含15个基因并富集于PPAR信号转导(PPAR signaling pathways)、补体(complement)及凝固级联(coagulation cascades)。此外,通过对核心基因及对应的Micro RNA进行表达谱分析及生存分析后发现其可能参与胆管癌的发展过程。结论:本研究利用生物信息学方法筛选出可能对胆管癌的早期诊断及治疗相关的152个DEGs及2个DEMs。此外,核心基因基质金属蛋白酶11(matrix metallopeptidase 11,MMP11)作为Has-mi R-125a-5p的靶基因可能在胆管癌的发展过程中扮演重要角色。