多环芳烃（polycyclic aromatic hydrocarbons,PAHs）是一类由两个或多个苯环组成的化合物,具有致癌、致畸、致突变的效应。因其化学结构稳定,难以降解,危害人类健康,引起人们广泛关注。PAHs修复技术多种多样,其中微生物修复环境中的PAHs具有安全、经济且无二次污染的优势,成为国内外争相研究的热点。萘一直作为PAHs研究的模式分子获得研究。萘降解基因调控的机制在革兰氏阴性菌中获得广泛研究。赤红球菌（Rhodococcus ruber）OA1（CCTCC AB2015073）是一株能以萘为碳源和能源生长的革兰氏阳性菌。本研究的目的是利用分子生物学手段揭示OA1萘降解的遗传背景。本研究以OA1为研究对象,构建了全基因组文库。针对萘降解关键基因nid A的保守区设计合成引物NID2F/2R,PCR方法合成了大小为213 bp的DIG标记的探针。利用探针对OA1基因组文库进行筛选后,通过核酸测序和功能分析,菌株OA1萘降解基因簇获得了首次鉴定。重组的Fosmid质粒测序分析表明,该质粒含43 kb大小的片段,组成两个基因簇（mph和nar）。其中,nar R1R2Aa Ab BC基因簇涉及萘降解途经,参与萘转化为水杨醛的过程。萘降解基因簇nar中,nar Aa和nar Ab基因分别编码假定的萘双加氧酶（NDO）的大、小亚基。NDO是起始萘降解的关键多组分酶。本文对nar Aa Ab基因进行了克隆、表达以及功能分析。SDS-PAGE显示,在55 k Da和23 k Da位置获得的两条目的蛋白条带的大小与目的蛋白（Nar Aa和Nar Ab）理论大小相符。酶学实验表明由Nar Aa和Nar Ab两组分组成的NDO可以在大肠杆菌BL21（DE3）发挥降解萘的功能。Nar Aa和Nar Ab系统进化树显示,nar Aa（nar Ab）在进化上包括四个亚类,依次为nar Aa（nar Ab）、Pdo A2（Pdo B2）、Pht Aa（Pht Ab）和Bph Aa（Bph A2）。系统进化树的构建对揭示OA1萘降解双加氧酶大、小亚基的分类和进化关系具有重要意义。本研究关于OA1萘降解相关酶的分子生物学分析和酶学鉴定进一步丰富了我们对革兰氏阳性菌萘降解机理的了解,扩大了利用该菌种修复环境PAHs污染的应用前景。