本文论述了组织结构设计中横向关系和纵向关系的设计方法，职能式、事业部式、区域式、矩阵式结构的特点，分析了组织战略、组织规模、组织生命周期、组织文化对组织结构的影响，组织应对外界不确定性和对外界资源依赖的应对方法。在此基础上通过分析七○八所面临的内外形势，得出了组织结构总体优化方案，一是七○八所应逐步剥离与主业无关的业务，通过股份制改造等方式逐步退出。二是要成立投资公司，集中力量做好我所的非船产业；三是成立信息技术部，全面规划协调所的信息化建设，开发信息应用技术；四是以82，83，84室为依托组建集团船舶及海洋工程研发中心。同时通过对局部组织结构的研究，得出了两点结论，一是81室应从产品科转向专业科，实行矩阵式管理，克服对人力资源等资源的争夺；二是机关应成立战略管理委员会、人力资源管理委员会和预算管理委员会，统一规划协调企业管理中的重大事项，与此同时财务管理必须从二级管理向一级管理过渡。