白头叶猴(Trachypithecusleucocephalus)微卫星文库的构建以及遗传多样性研究

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白头叶猴(Trachypithecus leucocephalus)又名乌猿,属灵长目旧大陆猴类疣猴亚科乌叶猴属动物,是我国特有的珍稀濒危动物,仅存于我国的广西省。近年来,其种群数量呈大幅下滑趋势,且目前栖息地呈现高度破碎化状态,总数已不足700只,在第六届国际灵长类保护大会上又被世界保护组织列入25种最濒危、最首要保护的灵长类之一。为制定合理的保护策略,更好的保护这一物种,从根本上了解濒危的状况,有必要从遗传多样性进行研究。但是,目前关于白头叶猴种群遗传学方面的研究还鲜有涉足。微卫星属于共显性遗传标记,可有效反映个体遗传信息和亲缘关系,在种群遗传学方面应用广泛。因此,在白头叶猴相关遗传研究严重贫乏的背景下,运用磁珠富集法,筛选出其特异的多态性微卫星位点,并对其遗传多样性进行了初步分析,主要研究结果如下:1.本研究通过一个白头叶猴血液样品,利用磁珠富集法筛选获得10个多态性微卫星位点。2. 10个位点的平均多态信息含量(PIC)为0.724。其中,WHL-02位点的多态信息含量(PIC)值最低,为0.590,WHL-01位点最高,达到了0.874。表明这10个位点均具有高度多态性。各位点等位基因数据经Cervus处理,当双亲遗传信息未知时,上述位点的累积排除率为0.9935;当双亲之一的遗传信息已知时,上述位点的累积排除率为0.9997,达到了相当高的排除能力,表明了已筛选获得的10个微卫星达到了白头叶猴个体识别和遗传多样性分析的目的,从而形成了物种遗传多样性检测的微卫星技术。3.白头叶猴样品在10个微卫星座位上的有效等位基因数变化较大。10个微卫星位点共检测到78个等位基因,WHL-01位点的等位基因数最高,为14个,片段大小为187-227bp;WHL-02位点的最低,只有4个,片段大小为207-213bp。所有检测个体中,10个微卫星位点的平均期望杂合度(HE)为0.778,平均观测杂合度(HO)为0.562。4.哈迪-温伯格平衡检测结果表明,WHL-04位点极显著偏离哈温平衡(P<0.01),WHL-05位点显著偏离哈温平衡(P<0.05),其余的8个位点(WHL-01、WHL-02、WHL-03、WHL-06、WHL-07、WHL-08、WHL-09、WHL-10)基因型分布均符合哈迪-温伯格平衡,并且各位点之间没有显著的连锁关系(P>0.05,Fisher检测)。5.经验证,通过构建微卫星文库筛选出白头叶猴的10个多态性微卫星位点,对于个体识别、父权鉴定及种群遗传结构等,都具有相当高的可信度。这些微卫星分子标记势必在白头叶猴的种群遗传学和保护遗传学研究中发挥十分重要的作用。同时,磁珠富集法是从物种的基因组中分离微卫星位点的首选策略。
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