肌萎缩侧索硬化多态性关联分析及基因突变研究

来源 :北京协和医学院 | 被引量 : 0次 | 上传用户:ruguofengdiao
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肌萎缩侧索硬化是由脑和脊髓运动神经元进行性退变引起的一种致死性瘫痪性疾病,散发性ALS占患病人群的近90%。ALS被认为是一种复杂性疾病。目前已有数个关于ALS的全基因组关联分析研究,并先后报道若干与增加ALS发病风险相关的单核苷酸多态性(SNP)位点。TARDBP基因突变存在于约0.5-3%的ALS人群中,很可能是ALS的又一易感基因。目的:在以中国人群组成的样本中研究和增加SALS致病风险相关的SNP;筛查我院SALS患者人群中TARDBP基因6号外显子蛋白编码区突变。方法:提取样本外周血基因组DNA,进行病例组(86例)和对照组(94例)年龄性别匹配,质谱法分型筛选出的SNP位点并进行关联分析;PCR扩增TARDBP基因6号外显子蛋白编码区,高分辨熔解法进行PCR产物的基因分型。结果:1、由中国人群组成的86例患者与94例对照组完成rs6700125、rs10260404. rs1942239、rs2279812、rs2405657、rs558889、rs6922711、rs9351470共8个SNP位点的基因分型,统计分析后无显著性差异。其中rs1942239、rs6922711在HapMap中欧洲人与中国人MAF接近,合并Cronin等人的研究数据显示rs1942239的P值减小,关联性增强。2、我院收集的89例SALS患者的TARDBP基因6号外显子蛋白编码区突变HRM法筛查发现两例TARDBP基因序列的1098位C突变为G,但是编码氨基酸不变且不影响剪切,考虑为同义突变,基因库及相关研究未见该突变的报道。结论:1、本研究为国际ALS的SNP数据库增加了亚洲人群的数据。在中国人群为样本的病例对照研究中,未发现某一特定SNP和增加SALS致病风险相关,合并Cronin研究数据后GALNT1(rs1942239邻近基因)与增加SALS致病风险相关。2、我院89例SALS患者未发现TARDBP基因的错义突变,结果提示在中国人群中TARDBP基因可能不是SALS的主要易感基因。
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