番茄（Solanum lycopersicum）在世界各地广泛种植,是第四大食用作物,仅次于小麦,水稻和大豆。为了进一步满足消费者需求,需要持续改进番茄的品质和产量。传统育种方式结合现代育种技术是番茄育种常用的方法。本研究是番茄育种项目中的一部分,选择高世代的优良自交系为亲本进行杂家组合配置,评估F1潜在的商业价值。抗病性育种是此项研究的重要组成部分,评价标准包括抗病性,果实品质（颜色,形状,硬度）和产量,并评价高世代优良自交系作为亲本潜在的价值。本研究包括露地栽培试验和温室栽培试验,采用聚合酶链式反应（PCR）和GBS技术检测多个特定农艺性状基因型,鉴定番茄生产中对多种病害的抗性。从亲本的抗病性推测杂交一代抗病性,以确定最终的优良杂交组合。研究项目分为四个部分,简述如下:使用PCR和GBS方法检测了共101份材料,分别来源于全国各地的栽培番茄材料及国外引进的材料,它们是高世代和低世代自交系,主要针对特定性状及抗病型进行了田间调查和基因型检测。特定性状包括果实形状、果实颜色及其他可能用于改进育种程序的性状;抗病性主要检测了11种抗病基因,包括番茄黄化曲叶病毒病（Ty-1,Ty-3）,番茄花叶病毒（Tm-2a）,根结线虫病（Mi-1）,叶霉病（Cf-5,Cf-9）,枯萎病（I-2）,枯萎病（Ve-2）,茎腐根腐病（Frl）,茎基腐病（Asc）和马铃薯孢囊线虫病（Hero）。检测结果表明,其中有4个自交系带7个抗病基因,9个自交系有6个抗病基因,13个自交系有5个抗性基因,其余的自交系带有少于4个抗病基因标记。同时,春季使用GBS技术对农艺性状和果实品质等相关性状的基因型进行检测。观察鉴定结果显示,有几个具有番茄红素（ogc）和成熟抑制（rin）基因标记的自交系可用于将来育种计划。结合分子标记技术和田间性状观察选育具有育种潜力的自交系是十分有效的。使用PCR分子技术对所选育的23份抗青枯病的自交系进行9种抗病基因标记检测。9种抗病标记分别为Ty-1,Tm-2a,Mi-1,Cf-5,Cf-9,Frl,Asc,Ve-2和I-2。发现2个自交系带有7个抗病基因,4个自交系具有6个抗病基因,8个自交系具有5个抗病基因,其余自交系具有4个以上的抗病基因。在露地栽培期间,抗青枯筛选自交系抗性较好,只有6份自交系未受青枯菌侵染。回交转育将ph-3（晚疫病）基因转移到自交系中。用PCR分子技术检测9个自交系中Ph-3基因的存在。采用叶片接种试验鉴定回交系的晚疫病的抗病性。春、秋两季田间分别从营养性状、果实性状、发病率、果实品质和产量等性状评估了130个杂交组合的。鉴定发现,其中有13个杂交组合表现良好,4个杂交组合田间表现最好,可以作为品种进行试种。杂交组合B1是无限生长,果实扁圆形,有果肩,单果重244.0g,果实较软,产量为3906 kg/667m~2。杂交组合B9是无限生长,果实扁果状,果肩稍凸,单果重139.1g,果实硬度高耐储存,产量4513kg/667m~2。杂交组合B10是无限生长,果圆形,果肩微凸,果重重185.5g,果实较软,产量4582 kg/667m~2。杂交组合Rf26是无限生长,果形扁圆形,果肩微凸,单果重200.8g,果实较硬耐储存,产量3504 kg/667m~2。结合抗病性标记基因检测技术（PCR和GBS）及田间和温室试验的表型评价进行相关种质资源的收集,是筛选和鉴定所需性状的亲本自交系和杂交商业品种的有效方法。这项研究选育出了几个在未来商业杂交番茄品种发展中有用的自交系。