深海耐压细菌的分离鉴定及一株希瓦新种的耐压机制初探

来源 :中国地质大学(北京) | 被引量 : 0次 | 上传用户:popularmp3007008
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
深海是一个黑暗、寡营养、高压及低温的极端环境,嗜(耐)压菌长期生存在这样的极端环境中,形成了不同于常压微生物的基因组成及生理机制。对耐压菌的研究有助于探寻生命起源和演化等科学问题,但目前人们对这些微生物耐压机理的了解仍然非常有限。本文对深海沉积物样品进行富集培养,分离耐压微生物菌种资源,并对一株深海来源的耐压希瓦氏菌进行了全基因组分析,从基因层面对其耐压耐冷机理进行了初步研究。本文首先采用低温高压的条件对雅浦海沟采集的沉积物样品进行富集培养,其后在常压下分离纯化出70株耐压细菌,分属于包括假单胞菌属在内的14个属。16S rRNA基因序列的相似度分析表明,其中菌株XXST-01~T与最相似的种Bacillus kyonggiensis NB22~T的相似度为98.40%。对其进行多相分类学研究发现,这株菌呈杆状、革兰氏阳性、有内生孢子和多鞭毛,其生长范围为10-45℃(最佳37℃),0-6%NaCl(最佳0-0.5%,w/v),0.1-50 MPa(最佳0.1 MPa)。菌株XXST-01~T的基因大小为4.39 Mb,G+C值为38.2 mol%,与模式菌株的ANI和DDH分析结果分别在70.91-90.15%,19.80-40.50%之间。综合XXST-01~T与模式菌株的16Sr RNA相似度及生理生化特性差异,鉴定该菌株为芽孢杆菌属的新种,并根据其分离位点将其命名为雅浦芽孢杆菌(Baciillus yapensis sp.nov.)。希瓦氏菌Shewanella sp.YLB-08~T分离自深海热液区,实验对比发现该菌比Baciillus yapensis XXST-01~T具更强的高压适应性,同时具备了嗜冷、嗜碱的特性,是一个典型的极端微生物,因此选择对其进行全基因组分析,探寻其耐压耐冷相关基因。基因组完成图测序以及基因组注释显示,其基因组大小为5785459 bp,G+C含量为43.52 mol%,含有5256个蛋白质编码基因,基因注释结果表明该菌包含大量呼吸链、抗氧化/DNA修复、冷激蛋白、转座酶相关基因,具有双鞭毛系统,含不饱和脂肪酸合成通路,使其对高压低温的深海环境具有良好的适应性。
其他文献
近年来,随着纳米科技在食品领域的迅速发展,纳米粒子(Nanoparticles,NPs)的生物安全性逐渐成为了一个研究热点。最新的研究发现,除了人造NPs之外,食品在热加工过程中也会产生NP
数据驱动建模方法是目前模型化方法研究的热点问题之一,因其无需完全掌握系统内部的运行机理,便可依据输入输出数据建立有效信息的映射关系,在解决复杂系统测量、控制和优化
大规模的刺激经济政策使我国企业的杠杆率不断增加,超过了警戒线。同时,企业加大研发投入是否能降低企业的杠杆率,政府补助在其中是否发挥作用,一直是学术界关注的焦点问题。本文选取2012年证监会行业分类中采矿业与制造业上市公司2015-2018年数据作为研究样本,对政府补助、企业研发投入与企业去杠杆三者之间的关系进行探讨,并以云南锡业股份有限公司为例,进一步挖掘在政府补助的调节作用以及企业研发投入对企业
ZTA陶瓷具有耐腐蚀、耐磨损、高硬度及高性价比等特性,是一种应用广泛的高性能结构陶瓷材料。采用纳米原料,在ZTA中引入Ti C可以进一步改善其力学性能,但因Ti C具有较强的共
随着常规油气藏勘探开发技术的不断进步,当前世界范围内具备开发潜力的大型常规油气藏越来越少。与此同时,占世界油气资源储量70%左右的非常规油气资源日益成为全球石油与天
作为控制金属腐蚀的产生及扩展的一种有效手段,飞机结构件用防腐剂(CICs)被广泛应用于飞机维修领域,以提高安全裕度。然而为了减轻飞机的重量,CICs构成的保护膜一般都较薄,导
表面等离子体共振是一种奇异的光学现象,因其对外界介质折射率的微小变化极其敏感,具有无需标识、灵敏度高、响应迅速等优点,在生物医学、食品安全、环境污染等领域具有重要
住房城乡建设部2014年公布《关于房屋建筑工程推广应用减隔震技术的若干意见(暂行)》(建质[2014]25号)文件,要求位于抗震设防烈度8度及以上地区的建筑建议采用减隔震技术。实
多金属氧簇作为一类重要的无机化合物,具有组成丰富、结构确定、功能多样等特点,是一类优秀的超分子组装构筑基元。通过共价键将有机基团接枝到多金属氧簇上不但可以扩展簇的结构,而且引入的有机官能团能与无机组分产生协同功能性,从而扩大其应用范围。三羟基配体和Anderson型多金属氧簇具有良好的结构匹配性,可以取代中心杂原子周围的全部或部分氧原子,获得有机基团共价修饰的多金属氧簇。在这类化合物已有的相关工作
聚乙二醇-聚乳酸(mPEG-PDLLA)是一种由亲水性PEG和疏水性PLA组成的两亲性嵌段共聚物,能够在水中自组装成胶束。将传统小分子药物与其结合使用可提高药物缓释效果,延长半衰期