广州市恙虫病危险因素与Ot-Sta56基因分型研究

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目的了解广州市恙虫病流行病学特征,探讨与发病密切相关的危险因素,明晰恙虫病东方体主要流行基因型别及与周边地区、国家的进化关系,为恙虫病防治和东方体演变提供科学依据。方法收集2015年1月1日—2016年12月31日广州市恙虫病病例急性期及恢复期血样、焦痂,鼠血及鼠脏器,恙螨等标本;采用描述性分析方法对广州市恙虫病流行病学特征进行分析,使用病例对照研究方法探讨潜在危险因素;采用圆形分布与集中度方法分析恙虫病季节性特征;使用描述性统计方法分析主要基因型分布特征与鼠形动物种群结构,采用最大似然法构建东方体系统进化树对东方体进行同源性分析。使用的统计软件包括RStudio 1.0.1、SPSS 20.0、EpiData 3.1、Sequencher 5.1、BioEdit 7.0.9、MEGA 5.0等。结果1.共收集问卷1105份,其中病例646份,对照459份;发病数最多的年龄组别为60~69岁组,其次为50~59岁组;职业分布中,农民占比最高59.28%,其次为家政或待业在家人员;文化程度中占比最高的为小学36.69%,其次为初中25.23%;有外出旅游史(OR=2.889,95%CI:1.842~4.351)、坐卧草地≥1次/周(OR=3.247,95%CI:1.502~7.042)、房屋地面为泥地有杂草(OR=2.092,95%CI:1.290~3.390)、屋内堆放杂草或农作物(OR=1.959,95%CI:1.246~3.080)和小区内经常有鼠活动等因素是广州市恙虫病的危险因素。2.广州市恙虫病发病有一定季节性特征,高峰日为每年8月1日,对应的高峰期为5月25日-10月8日,属夏秋型。3.广州市恙虫病发病存在地区不均衡性,中心城区如天河区、越秀区、黄埔区和荔湾区发病数均在30例以下,发病数较多的区域主要集中在周边地区,如从化区、番禺区、增城区,发病例数均在100例以上。4.此次研究期间共收集恙虫病病例血标本646份,鼠血标本600份;其中恙虫病病例血标本检测阳性154份,阳性率23.84%,测得型别分别为Karp型99株、Gilliam型30株、Kato型16株、TA763型9株,分别占比64.29%、19.48%、10.39%、5.84%;鼠血标本检测阳性9份,阳性率1.50%,测得型别分别为TA763型1株,Kato型2株,Karp型3株,Gilliam型3株。广州市主要流行株为Karp株,从行政区域看,基因型别在各区域的分布也存在不均衡现象,白云区和越秀区均只检出Karp型,其它区域均存在三种及以上型别,且Karp型占优势地位,而荔湾区和黄埔区未检测出阳性结果。5.广州市恙虫病东方体型别主要与台湾、泰国、新几内亚、日本、马来西亚等亲缘关系较近,代表株与参考株共有7对同源性为100%,同源性在95%以上的有54对,同源性在90%以上的有86对。6.2015-2016年在农村地区和城市地区共抓捕了1215只鼠形动物,共涵盖6种;褐家鼠为优势鼠种,共有959只,占比78.93%,黄胸鼠、臭鼩鼱、小家鼠、黄毛鼠和板齿鼠分别占比9.55%、6.91%、3.46%、0.49%和0.66%。结论1.外出旅游、坐卧草地、房屋地面有杂草、屋内堆放杂草或农作物和小区内经常有鼠活动等因素是广州地区恙虫病的危险因素。2.广州市属于恙虫病自然疫源地,属于夏秋型,高峰期在每年5-11月。3.广州市各行政区恙虫病发病数存在不均衡性,以周边地区发病数居多。4.广州市恙虫病流行株型别呈现多样性,以Karp型为主,Gilliam型、Kato型和TA763型并重。5.同源性分析表明广州市恙虫病东方体与台湾省及日本、泰国、韩国和马来西亚等国家亲缘关系较近。
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