本文运用因子分析方法对长春高新区与其它高新区在创新能力上的横向比较研究和长春高新区创新能力不同时段的纵向比较研究,确定吉林省中小高新技术企业集群在技术创新过程中存在的主要问题,然后有针对性地提出解决办法,建立一套适合吉林省中小高新技术企业集群创新的政策体系。通过研究发现创新资源投入能力不足是制约长春高新区高技术产业集群创新能力提高的主要因素。其主要原因是长春高新区产业集群发展得很不完善:一方面高新区在招商引资的项目审批中,往往注重项目投资的规模却忽视技术高度,导致规模扩展很快,但产品技术含量偏低;另一方面高新区产学研创新机制不完善;政府在服务体系及风险投资机制及人才政策上实施力度不够大,导致人才及研发经费的不足。针对这种情况提出提高长春高新区产业集群创新能力的对策是加强产业集群的建立。