珊瑚具有显著的生物多样性，从中分离到多种生物活性物质。海洋真菌往往能产生与陆地真菌不同的活性物质，研究推测共附生真菌可能是宿主活性物质的真正生产者。徐闻是中国大陆架唯一保存最完好的珊瑚自然生长区。本文从徐闻珊瑚保护区中采集3种石珊瑚，通过采用两种培养基分离珊瑚上共附生真菌，结合形态学和分子生物学方法进行鉴定，比较不同珊瑚上海洋真菌的分布和种属特征，采用琼脂扩散法对珊瑚共附生真菌的抗菌活性进行初步筛选。　　从3种珊瑚上共分离到54株真菌，其中普哥滨珊瑚上分离到23株，扁缩滨珊瑚上分离到21株，牡丹珊瑚上分离到10株。青霉属Penicillium sp.、曲霉属 Aspergillussp.数量最多，在3个样品上均有分布，分别占菌株总数的18.52％和29.63％。从各样品珊瑚共附生真菌的分布看，滨珊瑚上青霉属和曲霉属为优势种属，牡丹珊瑚曲霉属和肉座菌属为优势种属。　　结合ITS-rDNA基因序列的系统发育分析对珊瑚共附生可培养真菌多样性进行研究，将54株真菌的ITS-rDNA序列，与NCBI数据库GenBank中的序列进行相似性比较并构建系统发育树。结果表明，53株真菌分属于15个属，青霉属Penicillium sp.、曲霉属 Aspergillus sp.为优势菌属，另外还有少量Gibberella sp.、Tritirachium sp.、Hypocreaceae sp.、Basidiomycete sp.、Cochliobolus sp.、Didymellaceae sp.、Eutypella sp.、Lentinus squarrosulus、Nectria ipomoeae、Rigidoporus vinctus。另有编号C1-23的菌株相似率仅为90％，可能是一株新种。滨珊瑚多样性指数较高，菌株数量和种类较丰富，但普哥滨珊瑚上菌株在个别种属上集中，不及扁缩滨珊瑚的菌株分布均匀，牡丹珊瑚上菌株数量及种类均不及滨珊瑚，但种属的个体数量接近，均匀度也较好。　　经初步提取浓缩，将54株菌的发酵粗提取物进行抗菌实验和最小抑菌浓度实验。经过初筛有13株珊瑚真菌至少对一种指示菌表现出抗性，占菌株总数的24.07％，6株活性真菌来源于1号样品，4株来源于2号，3株来源于3号样品。13株菌分属于6个属，其中曲霉属和赤霉属各4株，数量最多，共占菌株总数的14.81％，2株为Hypocreaceae sp.，还有顶枝孢属、白色念珠菌和射脉菌属各1株。选择这13株菌经过两种培养基发酵，用石油醚、乙酸乙酯和正丁醇浸提的粗提物进行抑菌活性实验，发现乙酸乙酯和正丁醇粗提物抑菌活性较其他有机试剂提取活性好，C1-2，C1-10，C1-15经两种培养基发酵后的粗提物都具有良好的抑菌活性，针对某些指示菌的抑菌能力强。选择6株抑菌能力较强的菌株进行最小抑菌浓度的测试。珊瑚共生真菌对大肠杆菌和金黄色葡萄球菌抑菌作用最强，曲霉属和顶枝孢属真菌的抑菌活性较好，但是同属的菌株间抑菌能力不同。　　研究结果表明，石珊瑚上存在大量海洋真菌，种类丰富，而不同的珊瑚上真菌种群不同，而滨珊瑚种群多样性丰富，具有开发新种的潜力，同时一些菌株的代谢产物具有抑菌活性，尤其对革兰氏阴性菌活性较好，值得进一步研究。