南方红豆杉(Taxus chinensis var. mairei)又称美丽红豆杉，为国家一级保护植物，是红豆杉属(Taxus L.)中分布最广的植物种类之一。主要分布于长江流域、南岭山脉山区及河南、陕西、甘肃、台湾等省的山区或溪谷。本研究分析了不同产地南方红豆杉枝叶指纹图谱及影响紫杉醇含量的因素，旨在筛选出优质种源，为合理而有效地利用南方红豆杉提供科学依据。主要结论如下：1.采用相关系数法和夹角余弦法计算来自陕西周至和汉中；甘肃天水；安徽胡乐、聂家山和仙寓山6个不同产地的南方红豆杉指纹图谱相似度，发现除安徽聂家山2个样品外，其他样品的相似度均在0.8以上，同时建立了南方红豆杉枝叶的特征指纹图谱。通过对12个样品南方红豆杉指纹图谱的比较分析，发现各样品的指纹图谱均有12个共有峰，各共有峰的保留时间稳定，但相对含量差异较大。并据此建立了南方红豆杉枝叶的特征指纹图谱，可用于南方红豆杉的鉴定及质量控制。2.基于对陕西周至和汉中；甘肃天水；安徽胡乐和聂家山5个产地的南方红豆杉枝叶中紫杉醇含量分析，发现不同产地南方红豆杉枝叶中紫杉醇的含量有明显差异(P<0.05)，来源于陕西和甘肃的样品中紫杉醇含量明显高于来源于安徽的样品，其中陕西周至的样品中紫杉醇含量最高，紫杉醇含量是0.00613%。同时采用SPSS分析紫杉醇含量与当地气候因子、土壤中元素含量的相关性，发现紫杉醇含量与年平均气温、年降雨量、经度及土壤中的N、P、Zn元素和有机质含量存在一定的负相关；与纬度、土壤中的Cu、Fe、Mn元素含量呈一定的正相关；但相关性都不显著。3.采用SPSS分析曼地亚红豆杉(Taxus madia)和南方红豆杉枝叶中紫杉醇含量差异性，发现前者紫杉醇含量显著高于后者的(P<0.05)。曼地亚红豆杉枝叶中紫杉醇的平均含量为0.0241%，南方红豆杉枝叶中紫杉醇的平均含量为0.000814%。同时分析了来自陕西周至和汉中、安徽胡乐和聂家山4个产地不同生长年限及来自安徽聂家山和胡乐镇不同季节的南方红豆杉枝叶中紫杉醇含量，发现南方红豆杉经多年生长的老枝叶的紫杉醇含量高于当年生的幼嫩枝叶，含量差异最高达到2.7倍；不同采收季节的南方红豆杉紫杉醇含量也存在显著差异(P<0.05)，5月份的含量最高。