凝胶图像蛋白点分割算法研究

来源 :山东师范大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:zs001444
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
蛋白质是生命活动的基础,对其功能及表达水平等方面的研究具有重要的价值,而快速发展的蛋白质组学成为生物系统研究的一个新方向。将蛋白质有效的分离出来是对其表达模式分析的前提,它是利用双向凝胶电泳技术平台来操作运行,依靠蛋白质在凝胶中水平维度上等电点的不同和竖直维度上分子量之间的差异特征实现,最终输出的是一幅数字灰度图像。在这幅图像中含有成千上万个形状和大小各不相同的蛋白质点,其中每个点代表了一个蛋白质,并且这些点都是以不同灰度级的形式表现出来。凝胶图像的分析过程主要包括:蛋白点的分割与检测,蛋白点的表达量化、匹配等过程,其中,蛋白点分割占据着非常重要的地位,不准确的分割会严重影响后续对蛋白质表达变化的分析,因此,本论文重点研究了对凝胶图像的分割算法。本论文的主要工作如下:(1)研究了不同的滤波技术主要包括空域滤波、改进的NL-means算法和引导滤波器,概述了其相关原理并分别对凝胶图像进行实验仿真。同时,与处理后的凝胶图像剖面图相结合,进一步对上述滤波算法处理的效果做出对比分析,并作为选择滤波算法的依据。(2)将传统的图像分割算法(基于阈值、分水岭和水平集算法)和基于模糊聚类的算法应用于凝胶图像的分割中,并利用真实的凝胶图像对上述几种算法进行实验,通过对比观察实验结果来分析各种算法的分割效果,为下一步的研究提供基础。(3)凝胶图像上蛋白点并不是均匀分布且部分点的边界灰度与背景之间的对比并不是特别明显,由此将核模糊聚类算法引入到凝胶图像的分割中并对其进行改进。首先将引导滤波器与形态学方法结合起来,一方面用于对图像进行降噪处理以降低噪声的干扰,另一方面用于提高图像中蛋白点与背景之间的对比差异;然后在核函数中引入一个权值向量,与此同时利用样本方差来合理的计算核参数值,使核参数具有一定的自适应度;最后将改进后的核函数引入到模糊聚类算法里面,从而最终完成凝胶图像的聚类分割。在此过程中,分别利用模拟和真实的凝胶图像进行实验,并与其他算法做对比分析,验证了本论文算法的分割效果明显优于对比算法,在一定程度上能够分割出更多的微弱蛋白点,提高了凝胶图像分割的精度和准确性。
其他文献
近年来,计算机视觉技术正在蓬勃发展,这也为实现农业领域的自动化、智能化检测提供了理论依据,但在病虫害的检测识别方面还只局限于实验室基础阶段,没有产生实际的应用价值。如何
随着电子元件技术的飞速发展,军用设备上应用了大量电子元件,增加了军用设备的易摧毁性。等离子体由于其自身特性在高功率微波防护方面有着显著的优势。   时域谱元法(Spect
近几年来由于互联网的技术飞速的发展,数据量的增长也变得十分迅速,企业的越来越多的数据将面临着难以管理,存储设备的成本增加,信息保密性降低等诸多难题。大量的企业已经把
码分多址(Code Division Multiple Access,CDMA)系统是一种常见的扩频通信系统,具有保密性好、抗干扰能力强、系统容量大等优点。在CDMA系统中,多个用户的信号在发送端通过一
随着计算机以及互联网技术的日新月异的发展,网络上出现了大量的多媒体信息(如视频、图像、声音等),这些复杂多样的数据将人类带入到了计算机网络大数据时代。而这些信息数量
一个无线通信系统的频谱资源是有限的,进行合理的资源分配特别重要,无线资源管理的目标就是通过管理和协调无线资源使得系统资源的利用率达到最大化。对于下一代的无线通信系
本文首先分析了监视器的研究现状及发展趋势,然后应用目前迅速发展的FPGA技术,针对监视器实时监控、图像处理的应用需求,设计了一种加强监视器图像处理功能系统的解决方案,该方案
以信息优势为核心的军事革命是建构在先进的指挥、控制、通信、计算机、情报、监视、侦察及其一体化的信息战能力的基础的,在我国这个大的系统被称为综合电子信息系统。各种各
光正交频分复用(Optical Orthogonal Frequency Division Multiplexing, O-OFDM)技术以其高频谱利用率、强抗干扰能力以及良好的抗色散特性等诸多优势受到了通信界的广泛关注
针对数字图像的版权保护、内容认证等信息安全问题,数字水印技术起着极其重要的作用。大多数的常规数字图像水印嵌入水印时都是修改原始载体,而提取水印的时无法避免地造成了