山西老陈醋巴氏醋杆菌CGMCC 15730的基因组学分析及与其他优良菌株的互作

来源 :山西农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:Jewellerymay
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
巴氏醋杆菌CGMCC 15730(Acetobacter pasteurianus CGMCC 15730)分离自山西老陈醋醋醅中,具有较强的产酸能力和耐受高浓度醋酸的能力。本文基于Nanopore测序技术平台对巴氏醋杆菌CGMCC 15730的基因组进行了测序,丰富了巴氏醋杆菌的基因组学研究。同时,采用微生物培养的方法研究了巴氏醋杆菌CGMCC 15730与其他优良醋酸菌、乳酸菌和芽孢菌的相互作用,为实现山西老陈醋醋酸发酵过程优化提供理论基础。结果如下:(1)通过Nanopore测序技术平台对巴氏醋杆菌CGMCC 15730进行全基因测序,结合生物信息学分析对测序数据进行基因组组装、基因预测及功能注释。全基因测序结果表明,巴氏醋杆菌CGMCC 15730基因组由一个环状染色体和两个质粒组成,大小分别为2,760,994bp、201,873bp和246,670bp,G+C含量分别为52.88%、51.75%、53.69%。在染色体上,基因的平均长度为973bp,共预测到2,549个CDS。此外,染色体还包含15个核糖体RNA(r RNA)、56个转运RNA(t RNA)、1条成簇的、规律间隔的短回文重复序列(Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeat Sequences,CRISPR序列)、3个假基因和2个前噬菌体。在质粒1上,基因的平均长度为637bp,含有255个CDS和6个假基因。在质粒2上,基因的平均长度为625bp,有317个CDS和10个假基因。基于基因本体论数据库(Gene Ontology,GO)对蛋白编码基因进行GO注释,结果显示巴氏醋杆菌CGMCC15730的蛋白编码基因有45.44%在其参与的生物学途径(biological process)中发挥重要作用。基于直系同源蛋白簇(Clusters of Orthologous Groups,COG)数据库对蛋白编码基因进行COG注释,结果显示巴氏醋杆菌CGMCC15730的蛋白编码基因主要集中在基因的复制、重组和修复(Replication,recomination and repair)、氨基酸转运与代谢(Amino acid transport and metabolism)、能量的产生和转换(Energy production and conversion)等方面。对蛋白编码基因进行KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)注释,结果表明巴氏醋杆菌CGMCC15730的蛋白编码基因主要在氨基酸代谢(Biosynthesis of amino acids)、碳代谢(Carbon metabolism)和ABC转运(ABC transporters)等途径中发挥重要作用。基于全基因测序结果的共线性分析显示,巴氏醋杆菌CGMCC15730与A.pasteurianus 386B、A.pasteurianus Ab3和8株A.pasteurianus IFO全基因组序列高度相似,亲缘关系最近。(2)对纯培养与共培养体系中巴氏醋杆菌CGMCC 15730、巴氏醋杆菌A33、恶臭醋杆菌A8-7、汉氏醋杆菌J2-5的相互作用关系进行比较研究。结果发现,巴氏醋杆菌CGMCC 15730和巴氏醋杆菌A33共培养促进了巴氏醋杆菌A33的生长,提高了还原糖的利用率、总酸和乙偶姻的含量,还提高了有机酸、挥发性香气成分等风味物质的含量。在不同温度条件下,对巴氏醋杆菌CGMCC 15730与植物乳杆菌L7、植物乳杆菌L19、乳酸乳杆菌L729和戊糖片球菌L2422的相互作用进行研究。结果显示,在30℃条件下巴氏醋杆菌CGMCC 15730与植物乳杆菌L7共培养时,总酸含量相较于纯培养分别提高了74.49%,且明显高于37℃条件下的总酸含量,乳酸、乙酸等有机酸和乙偶姻、2,3,5,6-四甲基吡嗪等挥发性香气成分含量显著增加。并且当二者的比例为1:0.5时,促进了巴氏醋杆菌CGMCC 15730的生长,且共培养体系中总酸(4.12g/100g)、不挥发性酸(1.63g/100)和乙偶姻(2.50mg/g)含量明显提高,有机酸总量(3.9095 g/100g)提高,挥发性香气成分含量提高和种类增多。对巴氏醋杆菌CGMCC 15730与解淀粉芽孢杆菌B2030、枯草芽孢杆菌B803、解淀粉芽孢杆菌B1539的相互作用进行研究,结果显示,在37℃条件下,巴氏醋杆菌CGMCC15730与解淀粉芽孢杆菌B2030共培养,有利于产酸、产酯和产乙偶姻,草酸(0.3656g/100g)、乳酸(0.4520g/100g)和乙酸(0.9525g/100g)等有机酸含量提高,乙酸乙酯、2,3-丁二酮、2,3,5,6-四甲基吡嗪、愈创木酚等挥发性香气成分含量提高,且优于30℃条件下二者的共培养。
其他文献
自润滑关节轴承的优点是结构简单紧凑、拆装方便、高承载力、使用寿命长、转动灵活、免维护、设计性强等。根据具体的工作条件,可以选择合适的编织材料和基体材料。因此,自润滑关节轴承的应用范围越来越广,工作条件也各不相同,需要克服各种恶劣的天气、不同的载荷等。设备在工作过程中发生故障,主要原因是其中的某些关节轴承发生问题。由于轴承需要在高速、高温、重型载荷、高精度这些条件下进行工作,造成有的摩擦系数升高,有
学位
长期以来,我国的各级机关后勤服务管理工作一直处于一种封闭式的自我管理状态,在市场化发展的形势下后勤服务管理工作,俨然成为政府财政支出的一大负担,后勤服务的管理效率不高,难以满足市场经济条件下打造服务型政府的要求。本文试图就石林县机关后勤服务管理问题进行探究,通过解剖一个典型案例,以点带面的分析其中所存在的具体问题,找到破解问题的有效对策。本文从七个方面,对石林县机关后勤服务管理问题进行研究。一是绪
学位
职业倦怠是个体在从事工作中所显露出的精神疲乏、情绪低落、去人格化的病症现象,职业倦怠的产生严重影响了员工的工作质量。事业单位承担着维持社会运转的公共职能,事业单位人员需要确保自身有足够能力为社会大众提供高质量的公共服务,这个群体一旦出现职业倦怠,不仅会直接影响其个人身心健康,还会影响组织效率。对事业单位人员的职业倦怠进行研究有助于保障其心身健康,从而以更佳状态投入到公共服务管理活动中。双因素理论认
学位
研究背景:大数据跨境流动既产生经济效益又潜藏威胁国家主权安全的风险——数据跨境自由流动的本质是数据资源汇入以美国为主导的全球数字产业链中并产生经济效益,导致经济全球化下,主权国家随时都面临着来自美国霸权主义的威胁(2013年“棱镜门”为典型案例),因此数据主权下的数据跨境管理研究十分必要。发现问题:目前我国数据跨境管理体系的构建才刚起步,研究成果涵盖了立法建设、产业本身、安防管治等层面,但研究视角
学位
随着我国老年人口持续增多,养老问题已经成为民众关注的热点话题,如何为老年人提供更加优质全面的养老服务是政府部门当下必须要解决好的重要民生问题。长期以来,我国的养老和医疗是两个互相独立的系统,很多生病的老人为了就医治疗,不得不多次往返于医院、居住小区和养老院之间。医养结合模式的出现,不仅使得老人就医治疗更加便捷,还减轻了家庭的养老压力,并且,通过把医疗资源和养老资源进行充分整合,可以实现老年人健康养
学位
我国2008年首次提出“结构性减税”,2018年以来,随着国内经济下行和国际经济形势的双重压力,我国减税降费的力度空前加大,在国家出台的一系列减税降费政策里,让自然人纳税群体最直接感受到税收福利和优惠的,是2018年8月开始的新个人所得税改革。新个人所得税政策采取综合和分类相结合的征管模式,无论是在制度设计上还是征管模式上都有很大的创新,顺应了新时代人民群众对公平价值的诉求,符合时代发展的要求,让
学位
随着人工智能技术的不断发展,智能机器人开始在人们的生产生活中扮演重要的角色,拥有广泛的应用,如无人汽车驾驶、扫地机器人等。环境感知与理解是移动机器人智能化的关键因素之一,机器人通过传感器获取周围环境的信息,并且在计算机中计算分析理解。视觉传感器所获取的图像中蕴含了极为丰富的环境信息,如何利用这些图像数据,使得机器人能够像人的眼睛一样去感知和理解周围的环境,是人工智能与计算机视觉领域的一个重要问题。
学位
始于2019年末的新冠肺炎疫情来势汹汹,席卷整个神州大地,同时威胁着全球公众的生命安全,给各国政府带来了无法规避的负面影响。在疫情防控活动中,医疗设备、防护用品、药品等各种物资的合理配置作为工作重点,事关防控活动的有效进行。始终坚持在疫情防控一线的各级医院需要加大对医疗应急物资的关注,旨在满足客观所需,避免陷入到被动应对状态中。应急物资,是在应对公共安全事件、自然灾害、军事冲突等公共事件时不可或缺
学位
税务机关行使着国家收税权力,是组成国家行政权力的不可或缺的部分,承担着税务管理、税收征收、税务违法处理、税务检查、税收行政立法等职能。基层税务机关是依法治税基础的承担和实施者,在新一轮税务机构改革持续推进、税收法制化进程加快的背景下,基层税务机关执法遇到一些新问题,面临的执法风险不断加大,如何从容应对国地税合并后的执法困境,成了许多基层税务机关亟待解决的难题之一。本文综合应用文献分析、案例分析、实
学位
城乡发展的不平衡是导致农村衰落和农业人口向城市移动的主要原因,也可以说二者互为因果,彼此都在加剧另一方的程度。这种发展趋势与我国的可持续和全面小康社会的建设目标是相违背。为了保证城乡的均衡发展,减少城市和农村之间发展的差距,有效缓解农村地区农业产业落后的问题,我国政府在客观分析的基础上以乡村振兴战略为主体,希望通过财政支农政策促进农业现代化的发展,解决农业农村地区的落后问题。攀枝花作为四川乡村振兴
学位