水貂IGF-1R基因克隆、表达及多态性分析

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水貂(Neovison vison)作为一种小型珍贵毛皮动物,属于哺乳纲,食肉目,鼬科,鼬属。水貂主要经济价值体现在貂皮,而水貂的生长性状情况直接影响貂皮的质量。本研究以银蓝水貂和美国短毛黑水貂为研究对象,在DNA、RNA和蛋白质三个水平上研究IGF-1R基因与水貂生长发育的相关性,为深入研究与水貂生长性状相关的分子遗传标记提供基础数据,为水貂的选育奠定理论基础。水貂IGF-1R基因的克隆、真核表达及鉴定。提取水貂肝脏总RNA,将RNA反转录得到cDNA,根据GenBank报道的2个物种(雪貂、人)中IGF-1R序列为参考,设计水貂特异性IGF-1R引物,PCR扩增得到CDS序列,将PCR产物进行胶回收并与pEASY-Blunt Zero克隆载体连接并转化Trans1-T1 Phage Resistant Chemically Competent Cell中,经测序验证该序列为目的序列,从阳性重组质粒扩增目的片段连接到pEASY-Blunt M3载体上,经验证重组pEASY-Blunt M3-IGF-1R质粒通过脂质体法转染到293 T细胞中,提取总蛋白,并用Western Blot技术检测水貂IGF-1R蛋白的表达。结果表明:(1)以水貂肝脏为样品,利用RT-PCR成功扩增出全部的水貂IGF-1R基因CDS序列,长度为4 104 bp,编码1 367个氨基酸;(2)获得的水貂IGF-1R基因与雪貂、人同源基因相似性分别为99%和91%。认为该序列为水貂IGF-1R基因CDS序列;(3)成功构建pEASY-Blunt M3-IGF-1R真核表达载体,经验证成功获得水貂IGF-1R蛋白。本研究为从受体角度阐明水貂IGF-1R如何调控生长发育,为下一步功能研究奠定基础。水貂IGF-1R基因的SNPs筛查及其与生长性状的关联分析。选用同场打皮时银蓝水貂(♂,69只)和美国短毛黑水貂(♂,75只),测量体重体长,并采集血液样本。利用PCR产物直接测序技术进行部分外显子SNPs筛查,采用POPGene 32软件开展SNPs位点群体遗传结构分析,通过SPSS(19.0)软件GLM统计模型进行SNPs不同基因型与水貂生长性状的相关性分析。结果表明:在IGF-1R基因外显子序列中检测到2个同义突变位点:c.207G>A和c.1 782G>A。群体遗传学分析显示,在银蓝水貂群体中,c.207G>A位点为低度多态,c.1 782G>A属中度多态,而这2个位点在美国短毛黑水貂群体中均为中度多态。χ2检查表明,c.207G>A和c.1 782G>A两个位点在银蓝水貂和美国短毛黑水貂群体群体内分别处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05)。关联分析表明,c.1 782G>A位点与美国短毛黑水貂的体重显著相关(P<0.05),AA基因型个体的体重值显著高于GG基因型个体和GA基因型个体。因此,综上推断c.1 782G>A位点适合于美国短毛黑水貂体重的分子标记选择。
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